基因页面:MTRF1
总结吗?
GeneID | 9617年 |
象征 | MTRF1 |
同义词 | MRF1 | MTTRF1 | RF1 |
描述 | 线粒体转化释放因子1 |
参考 | MIM: 604601|HGNC: HGNC: 7469|运用:ENSG00000120662|HPRD: 06855|织女:OTTHUMG00000016790 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 13 q14.1-q14.3 |
帕斯卡假定值 | 0.013 |
夏洛克假定值 | 0.302 |
胎儿β | 0.527 |
eGene | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs17012924 | chr2 | 33612474 | MTRF1 | 9617年 | 0.1 | 反式 | ||
rs870686 | chr8 | 25253521 | MTRF1 | 9617年 | 0.15 | 反式 | ||
rs10521998 | chrX | 32437852 | MTRF1 | 9617年 | 0.13 | 反式 | ||
rs16998308 | chrX | 32442345 | MTRF1 | 9617年 | 0.03 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MTRF1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LRBA | 0.83 | 0.84 |
SPAG9 | 0.81 | 0.83 |
LONP2 | 0.80 | 0.83 |
PDZD8 | 0.80 | 0.83 |
IPO8 | 0.80 | 0.80 |
WDFY1 | 0.80 | 0.81 |
SCRN1 | 0.80 | 0.81 |
ACBD5 | 0.80 | 0.79 |
GZF1 | 0.80 | 0.82 |
LRRC58 | 0.80 | 0.83 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.59 | -0.54 |
AF347015.31 | -0.51 | -0.52 |
MT-CO2 | -0.51 | -0.51 |
C1orf54 | -0.50 | -0.49 |
AF347015.8 | -0.50 | -0.49 |
AF347015.27 | -0.49 | -0.49 |
MYL3 | -0.48 | -0.48 |
SYCP3 | -0.48 | -0.46 |
IL32 | -0.47 | -0.44 |
FXYD1 | -0.47 | -0.45 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0016149 | 翻译活动释放因素,密码子具体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006449 | 调节转化终止 | 助教 | 9838146 | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005739 | 线粒体 | 助教 | 9838146 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
通过CD40 DN HOLLMANN细胞凋亡 | 267年 | 178年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
奥斯瓦尔德在胶原凝胶DN造血干细胞 | 275年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多亏尤文和NFKB目标了 | 43 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA目标了 | 388年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌DN | 540年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三乳腺癌等正常 | 476年 | 285年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
研究人类MITODB 6 2002 | 429年 | 260年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
研究线粒体 | 447年 | 277年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA目标 | 535年 | 325年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |