基因页：CELSR1
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| 基因ID | 9620 |
| 象征 | CELSR1 |
| 同义词 | adgrc1 | cdhf9 | fmi2 | hfmi2 | me2 |
| 描述 | Cadherin EGF滞后七通G型受体1 |
| 参考 | MIM：604523|HGNC：HGNC：1850|Ensembl：ENSG0000000075275|HPRD：05160|Vega：Otthumg00000150423 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 22q13.3 |
| Pascal P值 | 0.73 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 3 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | Sift | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CELSR1 | CHR22 | 46859878 | G | 一个 | NM_014246 | 。 | 沉默的 | 原理图izophrenia | DNM:Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12216448 | 22 | 46759962 | CELSR1 | 4.649E-4 | 0.336 | 0.046 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2070396 | CHR21 | 30878751 | CELSR1 | 9620 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PI4KA | 0.92 | 0.92 |
| PIP4K2C | 0.92 | 0.90 |
| STXBP1 | 0.92 | 0.92 |
| SLC45A4 | 0.91 | 0.91 |
| Amigo1 | 0.91 | 0.91 |
| GFOD1 | 0.91 | 0.90 |
| STX1B | 0.91 | 0.90 |
| iqsec1 | 0.90 | 0.85 |
| 一个TP2B3 | 0.90 | 0.90 |
| MFSD6 | 0.90 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DBI | -0.52 | -0.63 |
| myl12a | -0.48 | -0.59 |
| RAB13 | -0.48 | -0.55 |
| Rab34 | -0.47 | -0.55 |
| Rhoc | -0.47 | -0.56 |
| GNG11 | -0.46 | -0.57 |
| C1orf61 | -0.46 | -0.61 |
| peci | -0.44 | -0.49 |
| BTBD17 | -0.44 | -0.59 |
| C1orf54 | -0.43 | -0.53 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004930 | G蛋白偶联受体活性 | nas | 9339365 | |
| 去：0005509 | calcium ion binding | IEA | - | |
| GO：0046983 | protein dimerization activity | nas | 9339365 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007417 | central nervous system development | nas | 大脑（GO期限：6） | 9339365 |
| 去：0007417 | central nervous system development | 塔斯 | 大脑（GO期限：6） | 10716726 |
| 去：0007218 | 神经肽信号通路 | IEA | 神经递质（GO期限：8） | - |
| 去：0001736 | 建立平面极性 | ISS | - | |
| 去：0001843 | 神经管闭合 | ISS | - | |
| 去：0007156 | 同粒细胞粘附 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9339365 |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-142-5p | 1886年 | 1892年 | M8 | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
| mir-182 | 190 | 196 | 1a | HSA-MIR-182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
| mir-199 | 1949年 | 1956年 | 1A，M8 | HSA-MIR-199A | cccaguucagacuaccuguuc |
| HSA-MIR-199B | cccaguguuuagacuaucuuc | ||||
| HSA-MIR-199A | cccaguucagacuaccuguuc | ||||
| HSA-MIR-199B | cccaguguuuagacuaucuuc | ||||
| mir-26 | 598 | 605 | 1A，M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| miR-96 | 189 | 196 | 1A，M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |