基因页:TCL1B
概括?
基因 | 9623 |
象征 | TCL1B |
同义词 | SYN-1 | TML1 |
描述 | T细胞白血病/淋巴瘤1B |
参考 | MIM:603769|HGNC:HGNC:11649|ENSEMBL:ENSG00000213231|HPRD:04795|Vega:Otthumg0000000028912 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q32.1 |
Pascal P值 | 0.131 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02171093 | 14 | 96152529 | TCL1B | 2.454e-4 | 0.342 | 0.037 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TCL1B_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Stag1 | 0.96 | 0.93 |
PAK2 | 0.96 | 0.93 |
不,不 | 0.96 | 0.86 |
XRN2 | 0.95 | 0.86 |
TNPO1 | 0.95 | 0.92 |
PBRM1 | 0.95 | 0.91 |
FUBP1 | 0.95 | 0.87 |
GNA13 | 0.95 | 0.90 |
SLC39A6 | 0.95 | 0.91 |
DHX9 | 0.95 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.70 | -0.74 |
pth1r | -0.68 | -0.75 |
TNFSF12 | -0.67 | -0.68 |
SLC16A11 | -0.67 | -0.68 |
HLA-F | -0.66 | -0.70 |
AIFM3 | -0.66 | -0.70 |
ifi27 | -0.66 | -0.82 |
FXYD1 | -0.65 | -0.82 |
AF347015.31 | -0.65 | -0.80 |
AF347015.27 | -0.65 | -0.79 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 | 87 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HATADA甲基化在肺癌DN中 | 38 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
苏胰腺 | 54 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |