基因页：RGS6
概括？
| 基因 | 9628 |
| 象征 | RGS6 |
| 同义词 | 差距 |
| 描述 | G蛋白信号传导的调节剂6 |
| 参考 | MIM：603894|HGNC：HGNC：10002|ENSEMBL：ENSG00000182732|Vega：Otthumg00000171340 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 14Q24.3 |
| Pascal P值 | 4.583E-5 |
| Sherlock P值 | 0.792 |
| 胎儿β | -1.44 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2332700 | CHR14 | 72417326 | CG | 1.686E-9 | 内含子 | RGS6 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26266528 | 14 | 72886537 | RGS6 | 3.8e-4 | 0.358 | 0.043 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7366678 | 0 | RGS6 | 9628 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| lrrc8a | 0.83 | 0.84 |
| PLXNB1 | 0.81 | 0.80 |
| DNM2 | 0.80 | 0.78 |
| ARAP1 | 0.79 | 0.80 |
| SAMD4B | 0.78 | 0.80 |
| ZNF687 | 0.78 | 0.77 |
| llgl1 | 0.77 | 0.75 |
| CTDSP2 | 0.76 | 0.79 |
| prex1 | 0.76 | 0.79 |
| TMEM104 | 0.76 | 0.78 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AL050337.1 | -0.49 | -0.54 |
| ATP5J | -0.47 | -0.49 |
| USMG5 | -0.47 | -0.57 |
| Sycp3 | -0.46 | -0.46 |
| UQCRB | -0.46 | -0.46 |
| GMFG | -0.45 | -0.46 |
| ST20 | -0.45 | -0.48 |
| Ly96 | -0.45 | -0.45 |
| lyplal1 | -0.45 | -0.44 |
| C8orf59 | -0.43 | -0.42 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 | 167 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu IL4信号传导 | 94 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kayo卡路里限制肌肉 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TGFB1和WNT3A的LABBE目标 | 111 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen滑膜肉瘤 | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染30分钟 | 56 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |