概括
基因 9637
象征 Fez2
同义词 hum3cl
描述 魅力和伸长蛋白Zeta 2
参考 MIM:604826|HGNC:HGNC:3660|ENSEMBL:ENSG00000171055|HPRD:09213|Vega:Otthumg00000152148
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P21
Pascal P值 0.076
Sherlock P值 0.228
胎儿β -0.815
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07234911 2 36825204 Fez2 1.38e-9 -0.016 1.37E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Sec16a 0.93 0.95
ZFYVE26 0.92 0.94
KIAA1310 0.92 0.94
ankfy1 0.91 0.94
trrap 0.91 0.94
USP22 0.91 0.94
TGFBRAP1 0.91 0.95
抽筋1l 0.91 0.94
HCFC1 0.91 0.92
URB1 0.91 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.68 -0.82
MT-CO2 -0.68 -0.83
AF347015.27 -0.66 -0.78
FXYD1 -0.65 -0.79
AF347015.33 -0.64 -0.76
AF347015.8 -0.64 -0.81
AF347015.21 -0.64 -0.88
higd1b -0.64 -0.80
ifi27 -0.64 -0.76
mt-cyb -0.64 -0.77

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 14690447
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007411 轴突指导 塔斯 Axon(GO期限:13) 9096408
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 9096408
去:0007165 信号转导 塔斯 9096408

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis乳腺癌进展DN 70 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa转变为可逆DN 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
jazag tgfb1发出信号 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 222 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Cerebellum标记 85 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜Kras致癌签名 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Myc Up监管 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应16 79 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
MiR-200BC/429 121 128 1A,M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu