基因页:Fez2
概括?
基因 | 9637 |
象征 | Fez2 |
同义词 | hum3cl |
描述 | 魅力和伸长蛋白Zeta 2 |
参考 | MIM:604826|HGNC:HGNC:3660|ENSEMBL:ENSG00000171055|HPRD:09213|Vega:Otthumg00000152148 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P21 |
Pascal P值 | 0.076 |
Sherlock P值 | 0.228 |
胎儿β | -0.815 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07234911 | 2 | 36825204 | Fez2 | 1.38e-9 | -0.016 | 1.37E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FEZ2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Sec16a | 0.93 | 0.95 |
ZFYVE26 | 0.92 | 0.94 |
KIAA1310 | 0.92 | 0.94 |
ankfy1 | 0.91 | 0.94 |
trrap | 0.91 | 0.94 |
USP22 | 0.91 | 0.94 |
TGFBRAP1 | 0.91 | 0.95 |
抽筋1l | 0.91 | 0.94 |
HCFC1 | 0.91 | 0.92 |
URB1 | 0.91 | 0.94 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.68 | -0.82 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.83 |
AF347015.27 | -0.66 | -0.78 |
FXYD1 | -0.65 | -0.79 |
AF347015.33 | -0.64 | -0.76 |
AF347015.8 | -0.64 | -0.81 |
AF347015.21 | -0.64 | -0.88 |
higd1b | -0.64 | -0.80 |
ifi27 | -0.64 | -0.76 |
mt-cyb | -0.64 | -0.77 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 14690447 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007411 | 轴突指导 | 塔斯 | Axon(GO期限:13) | 9096408 |
去:0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突(GO期限:5) | 9096408 |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 9096408 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis乳腺癌进展DN | 70 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa转变为可逆DN | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN | 149 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
jazag tgfb1发出信号 | 108 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Cerebellum标记 | 85 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜Kras致癌签名 | 89 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Myc Up监管 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应16 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
MiR-200BC/429 | 121 | 128 | 1A,M8 | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu |