基因页：FEZ1
概括?
| 基因ID | 9638 |
| Symbol | FEZ1 |
| 同义词 | UNC-76 |
| 描述 | fasciculation and elongation protein zeta 1 |
| 参考 | MIM:604825|HGNC：HGNC：3659|Ensembl：ENSG00000149557|HPRD：09212|Vega：Otthumg00000165886 |
| 基因type | protein-coding |
| 地图位置 | 11q24.2 |
| Pascal P值 | 0.009 |
| Fetal beta | -1.407 |
| eGene | Cerebellum 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| CV:GWAScat | 全基因组关联研究 | This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb. | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | gwasdbrecords for schizophrenia | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenics,schizophrenias | Click to show details |
| GO_Annotation | Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations | Hits with neuro-related keywords: 2 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：31 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | Chromosome | Position | eGene | 基因Entrez ID | PVALUE | qvalue | TSS distance | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1594142 | chr2 | 57263761 | FEZ1 | 9638 | 0.17 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
基因expression during devlopment (BrainCloud)
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| Top 10 positively co-expressed genes | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| 线圈 | 0.97 | 0.97 |
| CAND1 | 0.97 | 0.97 |
| KLHL7 | 0.97 | 0.97 |
| XRCC5 | 0.97 | 0.97 |
| POLR2B | 0.97 | 0.97 |
| ACTR3 | 0.97 | 0.97 |
| MARCH7 | 0.97 | 0.97 |
| ABCE1 | 0.96 | 0.96 |
| CDC5L | 0.96 | 0.97 |
| CCT6A | 0.96 | 0.96 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| MT-CO2 | -0.73 | -0.90 |
| FXYD1 | -0.73 | -0.90 |
| AF347015.31 | -0.73 | -0.89 |
| AF347015.33 | -0.72 | -0.88 |
| HLA-F | -0.71 | -0.81 |
| AF347015.27 | -0.71 | -0.87 |
| MT-CYB | -0.71 | -0.87 |
| AIFM3 | -0.70 | -0.80 |
| AF347015.8 | -0.70 | -0.88 |
| IFI27 | -0.70 | -0.86 |
Section III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0005515 | protein binding | 新闻学会 | 14690447|15383276|16169070 |
|
| GO:0043015 | gamma-tubulin binding | IEA | - | |
| Biological process | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0007411 | axon guidance | 塔斯 | Axon（GO期限：13） | 9096408 |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | neurite (GO term level: 5) | 9096408 |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | 塔斯 | 9096408 | |
| 细胞分量 | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| 去：0005813 | 中心体 | IEA | - | |
| GO:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| GO:0005886 | 质膜 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ACTG1 | ACT | ACTG | DFNA20 | DFNA26 | actin, gamma 1 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 12874605 |
| C13orf34 | 波拉|FLJ22624 | 染色体13开放阅读框34 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| CCL7 | fic |马克|MCP-3 |MCP3 |MGC138463 |MGC138465 |NC28 |scya6 |Scya7 | chemokine (C-C motif) ligand 7 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| CIB1 | CIB | KIP | KIP1 | SIP2-28 | calcium and integrin binding 1 (calmyrin) | - | HPRD | 11856312 |
| COL9A2 | DJ39G22.4 | EDM2 | MED | 胶原蛋白，IX型，Alpha 2 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| CSTF2 | CSTF-64 | cleavage stimulation factor, 3' pre-RNA, subunit 2, 64kDa | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| DIS3L2 | FAM6A | FLJ36974 | MGC42174 | dis3有丝分裂控制同源物（S. cerevisiae） - 类似2 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| Disc1 | C1orf136 | FLJ13381 | FLJ21640 | FLJ25311 | FLJ41105 | KIAA0457 | SCZD9 | disrupted in schizophrenia 1 | - | HPRD，Biogrid | 12874605 |
| GTF2F1 | BTF4 | RAP74 | TF2F1 | TFIIF | general transcription factor IIF, polypeptide 1, 74kDa | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| HeaTr2 | FLJ20397 |FLJ25564 |FLJ31671 |FLJ39381 | HEAT repeat containing 2 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| HTATSF1 | TAT-SF1 | dJ196E23.2 | HIV-1 Tat specific factor 1 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| 岩浆 | CGI-136 | mitochondria-associated protein involved in granulocyte-macrophage colony-stimulating factor signal transduction | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| NBR1 | 1A1-3B |KIAA0049 |M17S2 |MIG19 | neighbor of BRCA1 gene 1 | - | HPRD，Biogrid | 11856312 |
| NDUFB9 | B22 | DKFZp566O173 | FLJ22885 | LYRM3 | UQOR22 | NADH脱氢酶（泛氨基酮）1 Beta子复合物，9，22KDA | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| NEK1 | DKFZP686D06121 |DKFZP686K12169 |KIAA1901 |MGC138800 |NY-REN-55 | NIMA (never in mitosis gene a)-related kinase 1 | NEK1 interacts with FEZ-1. | BIND | 14690447 |
| OLFML3 | hnoel-iso |OLF44 | 嗅蛋白样3 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| P4HB | DSI | ERBA2L | GIT | PDI | PDIA1 | PHDB | PO4DB | PO4HB | PROHB | procollagen-proline, 2-oxoglutarate 4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), beta polypeptide | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| PDCD7 | ES18 | HES18 | MGC22015 | programmed cell death 7 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| PRKCZ | PKC-Zeta |PKC2 | protein kinase C, zeta | - | HPRD，Biogrid | 9971736 |
| pth | pth1 | 甲状旁腺激素 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| PTPR | PTPSIGMA | protein tyrosine phosphatase, receptor type, S | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| SMEK2 | FLFL2 | FLJ31474 | KIAA1387 | PP4R3B | PSY2 | smk1 | SMEK homolog 2, suppressor of mek1 (Dictyostelium) | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| STAR | STARD1 | 类固醇生成急性调节蛋白 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| TAC3 | NKB | NKNB | PRO1155 | ZNEUROK1 | tachykinin 3 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| Tomm20 | KIAA0016 |MAS20 |MGC117367 |MOM19 |TOM20 | translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast) | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| TTR | HST2651 |palb |TBPA | 经硫代蛋白 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
| TXNDC9 | APACD | 硫氧还蛋白域包含9个 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| 刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘sox4靶向 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONKEN UVEAL MELANOMA UP | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 UP | 146 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HAHTOLA MYCOSIS FUNGOIDES SKIN UP | 177 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHIRAISHI PLZF TARGETS UP | 10 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DIRMEIER LMP1 RESPONSE LATE UP | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SCHLESINGER METHYLATED DE NOVO IN CANCER | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH OCT4 TARGETS | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH SOX2 TARGETS | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH NOS TARGETS | 179 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH EED TARGETS | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH PRC2 TARGETS | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONDER CDH1 TARGETS 2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ROZANOV MMP14 TARGETS UP | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CERVERA SDHB TARGETS 1 UP | 118 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kannan TP53目标 | 58 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ROSS AML WITH MLL FUSIONS | 78 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DER IFN GAMMA RESPONSE DN | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JIANG HYPOXIA NORMAL | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOQUEST STEM CELL UP | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HUPER BREAST BASAL VS LUMINAL UP | 54 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ROSS LEUKEMIA WITH MLL FUSIONS | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VANASSE BCL2 TARGETS DN | 74 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PYEON CANCER HEAD AND NECK VS CERVICAL DN | 29 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 16 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金半岛L DISORDERS OLIGODENDROCYTE NUMBER CORR UP | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vandesluis Commd1目标3 DN | 39 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AZARE NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY STAT3 UP | 121 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIM MAMMARY STEM CELL UP | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |