基因页：Arhgef10

概括？
基因 9639
象征 Arhgef10
同义词 GEF10 | SNCV
描述 Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子10
参考 MIM：608136|HGNC：HGNC：14103|ENSEMBL：ENSG00000104728|HPRD：09735|Vega：Otthumg00000163626
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p23
Pascal P值 0.231
Sherlock P值 0.183
胎儿β 0.589
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
元
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
DNM：XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
Arhgef10 CHR8 1824769 G 一个 NM_014629 p.238d> n 错过 精神分裂症 DNM：XU_2012

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG10176011 8 1905280 Arhgef10 3.096E-4 0.342 0.04 DMG：Wockner_2014
CG25828741 8 1885575 Arhgef10 4.964E-4 0.607 0.047 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1338810 Chrx 94027806 Arhgef10 9639 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RCAN2 0.87 0.72
GLS 0.87 0.85
Rab11fip5 0.87 0.81
SCN1A 0.87 0.79
luzp1 0.87 0.78
ZNF365 0.87 0.76
Aak1 0.87 0.85
Gabra1 0.86 0.76
KCNA2 0.86 0.70
REPS2 0.86 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC006276.2 -0.42 -0.39
EFEMP2 -0.41 -0.45
Rab13 -0.41 -0.54
C9orf46 -0.40 -0.37
GTF3C6 -0.38 -0.32
Rab34 -0.38 -0.49
C1orf61 -0.37 -0.56
DBI -0.37 -0.48
RAMP2 -0.37 -0.38
NME4 -0.36 -0.40

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005089 Rho鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
去：0005085 鸟苷核苷酸交换因子活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0035023 调节Rho蛋白信号转导的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005622 细胞内 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
生物卡塔尔肌球蛋白途径 31 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta PAR1途径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid rhoa reg途径 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN 84 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH目标 127 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN 63 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由组蛋白乙酰化调节的玛丽亚达森 83 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein少突胶质细胞 74 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标胸腺 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF持续DN 61 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因