基因页：SH3PXD2A

概括？
基因 9644
象征 SH3PXD2A
同义词 鱼| SH3MD1 | TKS5
描述 SH3和PX域2A
参考 HGNC：HGNC：23664|ENSEMBL：ENSG00000107957|HPRD：10228|Vega：Otthumg0000000018997
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q24.33
Pascal P值 1.188E-4
胎儿β -0.742
DMG 1（＃研究）
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG02818775 10 105362057 SH3PXD2A 5.145e-4 0.4 0.047 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DPYSL3 0.95 0.94
FGD1 0.94 0.92
asxl1 0.93 0.94
KCTD7 0.93 0.95
WDR40A 0.93 0.93
patz1 0.93 0.93
JUP 0.93 0.93
C6orf134 0.93 0.93
PHF13 0.93 0.94
PHF2 0.92 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.74 -0.80
HLA-F -0.72 -0.76
AIFM3 -0.71 -0.74
AF347015.31 -0.71 -0.90
S100B -0.70 -0.82
MT-CO2 -0.70 -0.90
AF347015.27 -0.70 -0.86
aldoc -0.69 -0.67
AF347015.33 -0.69 -0.85
FXYD1 -0.69 -0.85

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0035091 磷酸肌醇结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007154 细胞通信 IEA -
去：0008152 代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0042995 细胞投影 IEA Axon（GO术语级别：4） -
去：0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病DN 121 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Smarca4目标 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 4906 4913 1A，M8 HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-124/506 343 349 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-143 2450 2456 1a HSA-MIR-143脑 ugagaugaagcacuguagcuca
HSA-MIR-143脑 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-144 4907 4913 1a HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-149 2380 2386 M8 HSA-MIR-149脑 Ucuggcuccucuucuucacuccc
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 2147 2154 1A，M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-185 4999 5005 M8 HSA-MIR-185脑 Uggagaaaggcaguuc
mir-199 5421 5427 M8 HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc
MiR-200BC/429 2006 2013 1A，M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-217 2047 2053 1a HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-23 3249 3256 1A，M8 HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-24 2378 2385 1A，M8 HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-25/32/92/363/367 4060 4067 1A，M8 HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-26 5210 5216 1a HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-29 7506 7513 1A，M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-30-5p 2768 2775 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-323 3249 3255 1a HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
mir-330 3088 3094 M8 HSA-MIR-330脑 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-338 1999 2005 1a HSA-MIR-338脑 uccagauuuuuguuga
mir-365 3688 3694 1a HSA-MIR-365 uaaugccccuaaaaaauccuuau
mir-410 3692 3698 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-488 358 364 1a HSA-MIR-488 cccagauauggcacucucucaa