基因页面:CTR9
总结吗?
| GeneID | 9646年 |
| 象征 | CTR9 |
| 同义词 | SH2BP1 | TSBP | p150 | p150TSP |
| 描述 | CTR9同族体,Paf1 / RNA聚合酶II复杂的组件 |
| 参考 | MIM: 609366|HGNC: HGNC: 16850|运用:ENSG00000198730|HPRD: 06717|织女:OTTHUMG00000165789 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 p15.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.877 |
| 夏洛克假定值 | 0.207 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs4971079 | chr1 | 155130390 | CTR9 | 9646年 | 0.09 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RFC1 | 0.92 | 0.92 |
| DDX42 | 0.92 | 0.92 |
| FKBP15 | 0.90 | 0.89 |
| GIGYF2 | 0.89 | 0.90 |
| ZNF638 | 0.89 | 0.91 |
| HNRNPUL2 | 0.89 | 0.89 |
| SUPT6H | 0.89 | 0.89 |
| ARID4B | 0.89 | 0.91 |
| SLTM | 0.89 | 0.91 |
| TPR | 0.89 | 0.90 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.75 | -0.77 |
| AF347015.21 | -0.74 | -0.77 |
| IFI27 | -0.73 | -0.75 |
| HIGD1B | -0.72 | -0.75 |
| MT-CO2 | -0.72 | -0.74 |
| ENHO | -0.71 | -0.77 |
| FXYD1 | -0.70 | -0.72 |
| C1orf54 | -0.69 | -0.75 |
| VAMP5 | -0.68 | -0.71 |
| MYL3 | -0.68 | -0.71 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DEURIG T细胞白血病PROLYMPHOCYTIC DN | 320年 | 184年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SENESE HDAC3目标 | 536年 | 332年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TIEN肠道益生菌6小时DN | 167年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1 DN的目标 | 459年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH自行车基因 | 648年 | 385年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DERβ干扰素反应 | 102年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML外事局标记 | 191年 | 131年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 对紫外线C0 SESTO回应 | 107年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1目标了 | 673年 | 430年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯TP53的目标了 | 602年 | 364年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1和TP53的目标 | 601年 | 369年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WHITFIELD细胞周期G1 | 148年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |