基因页：ppm1f

概括？
基因 9647
象征 ppm1f
同义词 CAMKP | CAMKPASE | FEM-2 | POPX2 | HFEM-2
描述 蛋白质磷酸酶，mg2+/mn2+依赖性1F
参考 HGNC：HGNC：19388|Ensembl：ENSG00000100034|HPRD：10163|Vega：Otthumg00000150835
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q11.22
Pascal P值 0.01
Sherlock P值 0.768
胎儿beta 1.047
耶和华 小脑半球
小脑
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.031

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17542473 CHR4 111182451 ppm1f 9647 0.08 反式
RS56094396 22 22278727 ppm1f ENSG00000100034.9 2.128e-7 0.01 28482 gtex_brain_putamen_basal
RS738858 22 22280917 ppm1f ENSG00000100034.9 5.633e-7 0.01 26292 gtex_brain_putamen_basal
RS240064 22 22281638 ppm1f ENSG00000100034.9 1.277E-6 0.01 25571 gtex_brain_putamen_basal
RS2329884 22 22282263 ppm1f ENSG00000100034.9 4.729E-7 0.01 24946 gtex_brain_putamen_basal
RS894095 22 22282776 ppm1f ENSG00000100034.9 4.729E-7 0.01 24433 gtex_brain_putamen_basal
。 22 22283231 ppm1f ENSG00000100034.9 9.157E-7 0.01 23978 gtex_brain_putamen_basal
RS33940969 22 22283232 ppm1f ENSG00000100034.9 9.684e-7 0.01 23977 gtex_brain_putamen_basal
RS2083565 22 22284357 ppm1f ENSG00000100034.9 4.729E-7 0.01 22852 gtex_brain_putamen_basal
RS5995257 22 22285987 ppm1f ENSG00000100034.9 4.409E-7 0.01 21222 gtex_brain_putamen_basal
RS2027790 22 22287964 ppm1f ENSG00000100034.9 3.39E-7 0.01 19245 gtex_brain_putamen_basal
RS94194 22 22288309 ppm1f ENSG00000100034.9 3.241E-6 0.01 18900年 gtex_brain_putamen_basal
RS5995268 22 22289031 ppm1f ENSG00000100034.9 5.041E-7 0.01 18178 gtex_brain_putamen_basal
RS5995269 22 22289397 ppm1f ENSG00000100034.9 7.673E-7 0.01 17812 gtex_brain_putamen_basal
RS240066 22 22292995 ppm1f ENSG00000100034.9 1.874E-6 0.01 14214 gtex_brain_putamen_basal
RS5756181 22 22305008 ppm1f ENSG00000100034.9 2.034E-6 0.01 2201 gtex_brain_putamen_basal
RS381849 22 22305713 ppm1f ENSG00000100034.9 2.513E-6 0.01 1496年 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共同表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
EIF4B 0.93 0.92
IGBP1 0.92 0.88
INTS7 0.91 0.92
COMMD2 0.91 0.89
arg2 0.90 0.91
kars 0.90 0.92
CCT3 0.90 0.89
polr1e 0.90 0.90
EEF2 0.90 0.89
Tex10 0.90 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.65 -0.86
AF347015.31 -0.65 -0.85
AF347015.33 -0.65 -0.85
FXYD1 -0.64 -0.87
C5orf53 -0.64 -0.77
HLA-F -0.63 -0.78
AF347015.27 -0.63 -0.84
ifi27 -0.63 -0.85
hepn1 -0.63 -0.77
mt-cyb -0.63 -0.83

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去：0000287 镁离子结合 IEA -
去：0004722 蛋白质丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性 IEA -
GO：0016787 水解酶活性 IEA -
去：0030145 锰离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去：0006470 蛋白氨基酸去磷酸化 IEA -
去：0006915 凋亡 IEA -
细胞成分 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去：0008287 蛋白质丝氨酸/苏氨酸磷酸酶复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃SZGR 2.0途径中的基因 信息
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 267 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2 DN 77 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
帕特森多西他赛电阻 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
糖尿病性肾病 86 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Georgantas HSC标记 71 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多（Acevedo）正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C簇 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C 47 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 245 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zembutsu对顺铂的敏感性 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ceribelli基因不活跃，受NFY的约束 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 942 948 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 941 948 1A，M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-149 1944年 1950年 M8 HSA-MIR-149脑 UCUGGCUCCGUGUUCACCC
MiR-200BC/429 719 725 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguaaaaAccgu
HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguaaaaAccgu
mir-217 864 870 1a HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-299-5p 3650 3656 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-342 2753 2759 M8 HSA-MIR-342脑 ucucacacagaaucgcacccccguc
mir-377 2752 2758 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggcaacuuuugu
mir-96 750 756 M8 HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc