基因页面:GCC2
总结吗?
| GeneID | 9648年 |
| 象征 | GCC2 |
| 同义词 | GCC185 | RANBP2L4 | REN53 |
| 描述 | 控制和卷曲螺旋域包含2 |
| 参考 | MIM: 612711|HGNC: HGNC: 23218|运用:ENSG00000135968|HPRD: 11001|织女:OTTHUMG00000153214 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 q12.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.036 |
| eGene | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0004 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.00755 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6754115 | chr2 | 109962343 | GCC2 | 9648年 | 0.12 | 独联体 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RPRD2 | 0.91 | 0.92 |
| EP300 | 0.91 | 0.94 |
| DIP2C | 0.90 | 0.93 |
| FOXJ2 | 0.90 | 0.91 |
| TGFBRAP1 | 0.90 | 0.92 |
| C11orf30 | 0.90 | 0.92 |
| CREBBP | 0.90 | 0.92 |
| SEC16A | 0.89 | 0.92 |
| CPSF7 | 0.89 | 0.91 |
| ARID1B | 0.89 | 0.92 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.70 | -0.80 |
| MT-CO2 | -0.69 | -0.80 |
| FXYD1 | -0.68 | -0.78 |
| HIGD1B | -0.67 | -0.79 |
| IFI27 | -0.66 | -0.75 |
| S100B | -0.65 | -0.74 |
| AF347015.21 | -0.65 | -0.83 |
| AF347015.27 | -0.65 | -0.75 |
| AF347015.33 | -0.65 | -0.72 |
| HSD17B14 | -0.65 | -0.72 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0042802 | 相同的蛋白结合 | 新闻学会 | 18243103 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0000139 | 高尔基体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005794 | 高尔基体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 王食道癌和正常 | 121年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过小道HAMAI细胞凋亡 | 584年 | 356年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌症发展和BOX4 DN | 32 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NING慢性阻塞性肺疾病 | 157年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯应对TRABECTEDIN DN | 271年 | 175年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 | 720年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 中村脂肪形成晚了 | 104年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LIM乳腺干细胞DN | 428年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 128 | 1506年 | 1512年 | 1 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
| hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
| mir - 135 | 896年 | 902年 | m8 | hsa - mir - 135 a | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA |
| hsa - mir - 135 b | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| mir - 214 | 1354年 | 1360年 | 1 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
| miR-27 | 1506年 | 1513年 | 1、m8 | hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
| hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
| miR-29 | 994年 | 1000年 | m8 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||