基因页：ralgps1
概括？
| 基因 | 9649 |
| 象征 | ralgps1 |
| 同义词 | ralgef2 | ralgps1a |
| 描述 | 带有pH结构域和SH3结合图案1的RAL GEF 1 |
| 参考 | MIM：614444|HGNC：HGNC：16851|ENSEMBL：ENSG00000136828|HPRD：11479|Vega：Otthumg00000020696 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9q33.3 |
| Pascal P值 | 0.021 |
| Sherlock P值 | 0.845 |
| 胎儿β | -0.025 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG14025518 | 9 | 129973991 | ralgps1 | 4.375E-4 | 0.423 | 0.045 | DMG：Wockner_2014 |
| CG03986101 | 9 | 129677031 | ralgps1 | 3.82e-8 | -0.018 | 1.09E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS36781 | CHR5 | 109289728 | ralgps1 | 9649 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TOPBP1 | 0.96 | 0.97 |
| RBM16 | 0.96 | 0.98 |
| thrap3 | 0.96 | 0.97 |
| NFX1 | 0.96 | 0.97 |
| rnasen | 0.96 | 0.96 |
| Stau1 | 0.95 | 0.97 |
| NUP153 | 0.95 | 0.97 |
| CNOT1 | 0.95 | 0.97 |
| TP53BP1 | 0.95 | 0.97 |
| DHX8 | 0.95 | 0.97 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.84 | -0.91 |
| MT-CO2 | -0.83 | -0.91 |
| FXYD1 | -0.82 | -0.89 |
| AF347015.33 | -0.80 | -0.87 |
| AF347015.27 | -0.80 | -0.87 |
| ifi27 | -0.80 | -0.88 |
| higd1b | -0.79 | -0.89 |
| AF347015.8 | -0.79 | -0.89 |
| mt-cyb | -0.78 | -0.86 |
| AF347015.21 | -0.78 | -0.92 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标DN | 124 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔衰老肾脏无血DN | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramaswamy转移 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染30分钟DN | 150 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lim乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |