概括
基因 9650
象征 mtfr1
同义词 CHPPR | FAM54A2
描述 线粒体裂变调节剂1
参考 HGNC:HGNC:29510|Ensembl:ENSG0000000066855|HPRD:12389|Vega:Otthumg00000164468
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q13.1
Pascal P值 0.182
Sherlock P值 0.977
胎儿beta 0.961
DMG 1(#研究)
耶和华 伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136例对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14299177 8 66557547 mtfr1 1.57E-8 -0.021 5.87E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12123144 CHR1 76550208 mtfr1 9650 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共同表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ABL1 0.96 0.96
PLCG1 0.96 0.95
ZNF532 0.95 0.95
UNK 0.95 0.96
KIAA0892 0.95 0.96
plagl2 0.95 0.92
dot1l 0.94 0.92
trrap 0.94 0.95
GCN1L1 0.94 0.93
spen 0.94 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.66 -0.74
AF347015.31 -0.65 -0.84
AF347015.27 -0.64 -0.82
MT-CO2 -0.63 -0.83
S100B -0.62 -0.77
ifi27 -0.62 -0.77
ACOT13 -0.61 -0.68
AF347015.33 -0.61 -0.76
mt-cyb -0.61 -0.79
FXYD1 -0.60 -0.77

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
Onken紫veal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey靶标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌叠素vs luminal 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌簇2 33 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯肝癌 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血祖先祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标胸腺 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因