基因页:mtfr1
概括?
基因 | 9650 |
象征 | mtfr1 |
同义词 | CHPPR | FAM54A2 |
描述 | 线粒体裂变调节剂1 |
参考 | HGNC:HGNC:29510|Ensembl:ENSG0000000066855|HPRD:12389|Vega:Otthumg00000164468 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q13.1 |
Pascal P值 | 0.182 |
Sherlock P值 | 0.977 |
胎儿beta | 0.961 |
DMG | 1(#研究) |
耶和华 | 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136例对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14299177 | 8 | 66557547 | mtfr1 | 1.57E-8 | -0.021 | 5.87E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12123144 | CHR1 | 76550208 | mtfr1 | 9650 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MTFR1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共同表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ABL1 | 0.96 | 0.96 |
PLCG1 | 0.96 | 0.95 |
ZNF532 | 0.95 | 0.95 |
UNK | 0.95 | 0.96 |
KIAA0892 | 0.95 | 0.96 |
plagl2 | 0.95 | 0.92 |
dot1l | 0.94 | 0.92 |
trrap | 0.94 | 0.95 |
GCN1L1 | 0.94 | 0.93 |
spen | 0.94 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.66 | -0.74 |
AF347015.31 | -0.65 | -0.84 |
AF347015.27 | -0.64 | -0.82 |
MT-CO2 | -0.63 | -0.83 |
S100B | -0.62 | -0.77 |
ifi27 | -0.62 | -0.77 |
ACOT13 | -0.61 | -0.68 |
AF347015.33 | -0.61 | -0.76 |
mt-cyb | -0.61 | -0.79 |
FXYD1 | -0.60 | -0.77 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Onken紫veal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey靶标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌叠素vs luminal | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌簇2 | 33 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯肝癌 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血祖先祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |