基因页：PLCH2

概括？
基因 9651
象征 PLCH2
同义词 PLC-L4 | PLC-ETA2 | PLCL4 | PLCETA22
描述 磷脂酶C ETA 2
参考 MIM：612836|HGNC：HGNC：29037|ENSEMBL：ENSG00000149527|Vega：Otthumg00000000719
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.32
Pascal P值 9.851E-7
Sherlock P值 0.639
胎儿β -0.785
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS4648845 CHR1 2387101 TC 4.033e-9 基因间 PEX10，PLCH2 dist = 43091; dist = 11797

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS3747518 CHR2 163128724 PLCH2 9651 0.09 反式
RS9461864 CHR6 33481468 PLCH2 9651 0.17 反式
RS1401787 Chr11 20740929 PLCH2 9651 0.17 反式
RS16955618 CHR15 29937543 PLCH2 9651 0.07 反式
RS11882889 CHR19 19887684 PLCH2 9651 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
在喉癌中放大了耶维宁 40 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由Kras Pten Up 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔祖先DN 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因