概括
基因 9658
象征 ZNF516
同义词 HST287
描述 锌指蛋白516
参考 MIM:615114|HGNC:HGNC:28990|ENSEMBL:ENSG00000101493|Vega:Otthumg00000165995
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18Q23
Pascal P值 0.085
胎儿β 1.171
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18572343 18 74153030 ZNF516 5.235E-4 0.296 0.048 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PSAP 0.81 0.81
PDK2 0.81 0.85
0.79 0.77
IGSF11 0.79 0.80
hiatl1 0.78 0.76
ACO2 0.77 0.77
Dennd5a 0.77 0.73
gpm6b 0.77 0.81
sumf1 0.77 0.78
IPO13 0.76 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RP9P -0.56 -0.62
FAM159B -0.50 -0.61
AC005921.3 -0.50 -0.58
AC010300.1 -0.48 -0.50
EIF5B -0.45 -0.49
AC135724.1 -0.44 -0.43
IL32 -0.42 -0.32
AC073534.1 -0.41 -0.50
SNHG12 -0.41 -0.44
AC011475.1 -0.40 -0.41

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌群集1 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tomlins前列腺癌DN 40 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1向上 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时DN 101 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 97 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Beier神经胶质瘤干细胞向上 39 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 228 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因