基因页：WSCD2
概括？
| 基因 | 9671 |
| 象征 | WSCD2 |
| 同义词 | - |
| 描述 | WSC域包含2 |
| 参考 | HGNC：HGNC：29117|Ensembl：ENSG00000075035|HPRD：17196|Vega：Otthumg00000169579 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12q23.3 |
| Pascal P值 | 0.002 |
| Sherlock P值 | 0.116 |
| 胎儿β | -2.832 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 表达 | 基因表达的荟萃分析 | p值：2.231 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17392743 | CHR1 | 54764240 | WSCD2 | 9671 | 0.19 | 反式 | ||
| RS2502827 | CHR1 | 176044216 | WSCD2 | 9671 | 0.19 | 反式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | WSCD2 | 9671 | 6.395E-8 | 反式 | ||
| RS3845734 | CHR2 | 171125572 | WSCD2 | 9671 | 0 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | WSCD2 | 9671 | 2.745e-6 | 反式 | ||
| RS17762315 | CHR5 | 76807576 | WSCD2 | 9671 | 0.03 | 反式 | ||
| RS2393316 | Chr10 | 59333070 | WSCD2 | 9671 | 0.2 | 反式 | ||
| RS1255634 | CHR14 | 63972654 | WSCD2 | 9671 | 0.16 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | WSCD2 | 9671 | 1.577E-15 | 反式 | ||
| RS1041786 | CHR21 | 22617710 | WSCD2 | 9671 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RNF216 | 0.92 | 0.92 |
| C22orf30 | 0.92 | 0.93 |
| GAPVD1 | 0.91 | 0.92 |
| 阿达 | 0.91 | 0.92 |
| ankfy1 | 0.91 | 0.93 |
| Ankrd17 | 0.91 | 0.91 |
| KIAA0947 | 0.91 | 0.92 |
| KDM2A | 0.91 | 0.93 |
| VPS13B | 0.90 | 0.91 |
| UBR2 | 0.90 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.75 | -0.77 |
| MT-CO2 | -0.73 | -0.76 |
| higd1b | -0.72 | -0.77 |
| AF347015.21 | -0.72 | -0.79 |
| ifi27 | -0.71 | -0.72 |
| FXYD1 | -0.70 | -0.73 |
| C1orf54 | -0.69 | -0.79 |
| AF347015.8 | -0.67 | -0.72 |
| mt-cyb | -0.67 | -0.70 |
| AF347015.33 | -0.67 | -0.68 |
第三节。基因本体论注释
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Gaussmann MLL AF4融合靶向DN | 90 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 结肠癌中的韦伯甲基化 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| fontaine卵泡甲状腺腺瘤 | 75 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-135 | 1262 | 1269 | 1A，M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| mir-181 | 1546年 | 1553年 | 1A，M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-29 | 585 | 591 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
| HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
| HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
| mir-34/449 | 882 | 888 | M8 | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
| HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
| HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
| HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||