基因页：SDC3
概括？
| 基因 | 9672 |
| 象征 | SDC3 |
| 同义词 | SDCN | Synd3 |
| 描述 | Syndecan 3 |
| 参考 | MIM：186357|HGNC：HGNC：10660|HPRD：01719| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p35.2 |
| Pascal P值 | 0.079 |
| 胎儿β | -0.495 |
| 支持 | 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ADNP2 | 0.95 | 0.96 |
| RRP1B | 0.94 | 0.93 |
| BMPR1A | 0.93 | 0.91 |
| C20ORF11 | 0.93 | 0.92 |
| MEX3C | 0.93 | 0.94 |
| DCP1A | 0.93 | 0.93 |
| ZXDA | 0.93 | 0.94 |
| RBM15 | 0.93 | 0.93 |
| AMMECR1L | 0.93 | 0.93 |
| ZNF778 | 0.93 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.68 | -0.84 |
| MT-CO2 | -0.68 | -0.85 |
| FXYD1 | -0.67 | -0.82 |
| AF347015.27 | -0.67 | -0.81 |
| AF347015.33 | -0.66 | -0.80 |
| C5orf53 | -0.66 | -0.72 |
| AF347015.8 | -0.65 | -0.83 |
| S100B | -0.65 | -0.77 |
| ifi27 | -0.65 | -0.77 |
| mt-cyb | -0.65 | -0.81 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 桶 | CAGH39 |CMG |FLJ22219 |FLJ31914 |lin2 |Micpch |TNRC8 | 钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶（Maguk家族） | - | HPRD | 10460248 |
| CSK | MGC117393 | C-SRC酪氨酸激酶 | - | HPRD，Biogrid | 9553134 |
| cttn | EMS1 |FLJ34459 | cortactin | - | HPRD，Biogrid | 9553134 |
| CUX1 | CASP |CDP |CDP/CUT |CDP1 |coy1 |cutl1 |Cux |clox |CUX/CDP |golim6 | Nbla10317 | p100 | p110 | p200 | p75 | 类似于CUT的同源ox 1 | - | HPRD | 8662884 |
| FGF2 | BFGF |FGFB |HBGF-2 | 成纤维细胞生长因子2（基本） | - | HPRD，Biogrid | 8344959 |
| Fyn | MGC45350 |SLK |syn | Fyn Oncogene与SRC，FGR，是的 | - | HPRD，Biogrid | 9553134 |
| MDK | FLJ27379 |Mk |negf2 | Midkine（神经突生长因子2） | - | HPRD | 9089390 |
| PTN | 竖琴|HBGF8 |hbnf |negf1 | pleiotiotirophin | - | HPRD | 8175719 |
| SDCBP | MDA-9 |ST1 |SYCL |Tacip18 | 联合结合蛋白（同步） | Syndecan-3与ST-1相互作用。这种相互作用是在人类Syndecan-3和大鼠ST-1之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 11152476 |
| tuba1a | B-Alpha-1 |FLJ25113 |lis3 |tuba3 | 微管蛋白，α1A | - | HPRD，Biogrid | 9553134 |
| 塔布 | M40 |MGC117247 |MGC16435 |OK/SW-CL.56 |tubb1 |tubb5 | 微管蛋白，β | 重构的复合物 | Biogrid | 9553134 |
| tubb2a | tubb |tubb2 |DJ40E16.7 | 微管蛋白，β2A | - | HPRD，Biogrid | 9553134 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG ECM受体相互作用 | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg细胞粘附分子凸轮 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Syndecan 3途径 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HS堵嘴降解 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组软骨素硫酸盐皮肤硫酸盐代谢 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HS GAG生物合成 | 31 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome硫酸乙酰肝素肝素HS GAG代谢 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome糖胺聚糖代谢 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GAG合成需要四糖接头序列 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向DN | 260 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johansson神经胶质作用是PDGFB | 58 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| iwanaga癌变由Kras Pten Up | 181 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巴索毛毛细胞白血病DN | 80 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BMI1和PCGF2的Wiederschain目标 | 57 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOSCO干扰素诱导的抗病毒模块 | 78 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM有关联 | 171 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |