基因页面:DEPDC5
总结吗?
GeneID | 9681年 |
象征 | DEPDC5 |
同义词 | DEP.5 | FFEVF |
描述 | 管理域包含5 |
参考 | MIM: 614191|HGNC: HGNC: 18423|运用:ENSG00000100150|HPRD: 16795|织女:OTTHUMG00000030926 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 22 q12.3 |
帕斯卡假定值 | 0.338 |
夏洛克假定值 | 0.455 |
胎儿β | -0.067 |
DMG | 2(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.031 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg25798026 | 22 | 32149910 | DEPDC5 | 1.664的军医 | -0.24 | 0.033 | DMG: Wockner_2014 |
cg03550506 | 22 | 32149733 | DEPDC5 | 1.37 e-9 | -0.015 | 1.37 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DEPDC5_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ATG9A | 0.93 | 0.92 |
NFE2L1 | 0.91 | 0.91 |
MAPK8IP3 | 0.91 | 0.89 |
ZER1 | 0.91 | 0.89 |
AGPAT3 | 0.90 | 0.90 |
DAGLA | 0.90 | 0.91 |
AMIGO1 | 0.90 | 0.90 |
DENND4B | 0.90 | 0.88 |
TECPR2 | 0.89 | 0.89 |
KIAA0513 | 0.88 | 0.90 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GNG11 | -0.57 | -0.59 |
AF347015.21 | -0.55 | -0.50 |
DBI | -0.54 | -0.60 |
C1orf54 | -0.53 | -0.57 |
SYCP3 | -0.53 | -0.61 |
IL32 | -0.52 | -0.53 |
AL050337.1 | -0.51 | -0.58 |
C1orf61 | -0.49 | -0.51 |
CLEC2B | -0.48 | -0.50 |
FAM159B | -0.47 | -0.66 |
第三部分。基因本体论注释
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0007242 | 细胞内的信号级联 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GINESTIER乳腺癌ZNF217放大DN | 335年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHLOSSER血清反应了 | 134年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林APC的目标 | 77年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
佐藤在胰腺癌1被甲基化 | 419年 | 273年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AGUIRRE胰腺癌拷贝数DN | 238年 | 145年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
开罗肝母细胞癌类DN | 210年 | 141年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |