基因页：Clint1
Summary？
| 基因ID | 9685 |
| 象征 | Clint1 |
| 同义词 | 克林特| enth | epn4 | epnr |
| 描述 | 网格蛋白相互作用器1 |
| 参考 | MIM：607265|HGNC：HGNC：23186|ENSEMBL：ENSG00000113282|HPRD：06273|Vega：Otthumg00000163527 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5q33.3 |
| Pascal P值 | 0.139 |
| Sherlock P值 | 0.078 |
| 胎儿β | 0.618 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:gwasdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 3 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01718 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | Psr: 0.00459 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG11669387 | 5 | 157285902 | Clint1 | 9.91E-8 | -0.007 | 2.2e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2403775 | CHR8 | 133472361 | Clint1 | 9685 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| snap91 | 0.94 | 0.95 |
| WDR7 | 0.93 | 0.92 |
| prkar1a | 0.92 | 0.92 |
| ATP6V1A | 0.92 | 0.92 |
| PNMA2 | 0.91 | 0.92 |
| plekhb2 | 0.90 | 0.91 |
| USP32 | 0.90 | 0.90 |
| RTN3 | 0.90 | 0.89 |
| cltc | 0.90 | 0.90 |
| KIAA1467 | 0.90 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Rab34 | -0.57 | -0.63 |
| C1orf61 | -0.55 | -0.67 |
| ACSF2 | -0.53 | -0.54 |
| AP002478.3 | -0.52 | -0.56 |
| AF347015.21 | -0.52 | -0.48 |
| EIF4EBP3 | -0.51 | -0.56 |
| PLA2G5 | -0.51 | -0.45 |
| C1orf54 | -0.51 | -0.54 |
| higd1b | -0.51 | -0.48 |
| AC098691.2 | -0.50 | -0.53 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 14675752 | |
| 去：0008289 | 脂质结合 | IEA | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006897 | 内吞作用 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 10942595 | |
| 去：0005737 | cytoplasm | IEA | - | |
| GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO:0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-137 | 1007 | 1013 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
| mir-145 | 545 | 552 | 1A，M8 | HSA-MIR-145 | guccaguuucccaggaaucccuu |
| mir-155 | 1134 | 1140 | 1a | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |
| mir-221/222 | 1057 | 1063 | 1a | hsa-miR-221脑 | agcuacauugucugugggggguc |
| hsa-miR-222脑 | agcuacaucuggcuacugggucuc | ||||
| mir-33 | 1173 | 1179 | 1a | HSA-MIR-33 | Gugcauuguuguugcauug |
| HSA-MIR-33b | Gugcauugcuguugcauugca | ||||
| mir-433-3p | 1153 | 1159 | M8 | HSA-MIR-433脑 | aucaugauggggcuccucggugu |
| mir-505 | 1265 | 1271 | 1a | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |