基因页:CD70
概括?
基因 | 970 |
象征 | CD70 |
同义词 | CD27L | CD27LG | TNFSF7 | TNLG8A |
描述 | CD70分子 |
参考 | MIM:602840|HGNC:HGNC:11937|ENSEMBL:ENSG00000125726|HPRD:18515|Vega:Otthumg00000181834 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13 |
Pascal P值 | 0.952 |
胎儿β | 0.016 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23263923 | 19 | 6591204 | CD70 | 3.5e-11 | -0.031 | 3.6e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
CG25949886 | 19 | 6590516 | CD70 | 8.66e-8 | -0.006 | 2e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CD70_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
G6PC3 | 0.81 | 0.84 |
ORAI3 | 0.79 | 0.79 |
忍者 | 0.79 | 0.83 |
TMEM129 | 0.77 | 0.81 |
CPT2 | 0.77 | 0.78 |
DNASE2 | 0.76 | 0.80 |
PPIF | 0.76 | 0.76 |
CDK2AP2 | 0.75 | 0.80 |
pycr2 | 0.74 | 0.78 |
COMT | 0.74 | 0.77 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC005921.3 | -0.43 | -0.50 |
PHF14 | -0.42 | -0.43 |
EIF5B | -0.42 | -0.50 |
RBMX2 | -0.42 | -0.45 |
thoc2 | -0.41 | -0.42 |
EIF3J | -0.41 | -0.39 |
CCDC112 | -0.41 | -0.29 |
AC008865.3 | -0.40 | -0.39 |
RBM25 | -0.40 | -0.42 |
CIR1 | -0.40 | -0.37 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM对TSA和Decitabine的反应 | 129 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合DN的Begum目标 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hasina NOL7目标 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标1向上 | 140 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卫星对干扰素βdn的响应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 | 111 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集16 | 26 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML,11q23重新排列 | 22 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |