概括
基因 970
象征 CD70
同义词 CD27L | CD27LG | TNFSF7 | TNLG8A
描述 CD70分子
参考 MIM:602840|HGNC:HGNC:11937|ENSEMBL:ENSG00000125726|HPRD:18515|Vega:Otthumg00000181834
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13
Pascal P值 0.952
胎儿β 0.016
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23263923 19 6591204 CD70 3.5e-11 -0.031 3.6e-7 DMG:JAFFE_2016
CG25949886 19 6590516 CD70 8.66e-8 -0.006 2e-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
G6PC3 0.81 0.84
ORAI3 0.79 0.79
忍者 0.79 0.83
TMEM129 0.77 0.81
CPT2 0.77 0.78
DNASE2 0.76 0.80
PPIF 0.76 0.76
CDK2AP2 0.75 0.80
pycr2 0.74 0.78
COMT 0.74 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC005921.3 -0.43 -0.50
PHF14 -0.42 -0.43
EIF5B -0.42 -0.50
RBMX2 -0.42 -0.45
thoc2 -0.41 -0.42
EIF3J -0.41 -0.39
CCDC112 -0.41 -0.29
AC008865.3 -0.40 -0.39
RBM25 -0.40 -0.42
CIR1 -0.40 -0.37

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM对TSA和Decitabine的反应 129 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合DN的Begum目标 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hasina NOL7目标 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1向上 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卫星对干扰素βdn的响应 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集16 26 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML,11q23重新排列 22 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因