基因页:ULK2
概括?
基因 | 9706 |
象征 | ULK2 |
同义词 | ATG1B | UNC51.2 |
描述 | UNC-51喜欢自噬激活激活激酶2 |
参考 | MIM:608650|HGNC:HGNC:13480|ENSEMBL:ENSG00000083290|HPRD:10556|Vega:Otthumg00000059511 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p11.2 |
Pascal P值 | 0.013 |
Sherlock P值 | 0.159 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ULK2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0048675 | 轴突扩展 | IEA | Axon(GO期限:13) | - |
GO:0048671 | 附带发芽的负调节 | IEA | Axon(GO术语级别:15) | - |
去:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
自噬调节 | 35 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg mtor信号通路 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MTOR 4 Pathway | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘vmyb的目标 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标8小时DN | 129 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17P11扩增子 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML Fab标记 | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射2G后的生存率不佳 | 171 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUILLETTE CLL 13Q14删除DN | 60 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mizushima自噬体形成 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 1474 | 1480 | M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-124.1 | 181 | 187 | M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-124/506 | 181 | 187 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-130/301 | 591 | 598 | 1A,M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
mir-137 | 2164 | 2170 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
MiR-200BC/429 | 910 | 917 | 1A,M8 | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
mir-22 | 1060 | 1066 | M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
mir-26 | 1215 | 1222 | 1A,M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc | ||||
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
mir-299-5p | 1223 | 1229 | 1a | HSA-MIR-299-5P | ugguuuaccgucccacauacau |
mir-323 | 1077 | 1083 | M8 | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
mir-328 | 961 | 968 | 1A,M8 | HSA-MIR-328脑 | cuggcccucugccuuccgu |
mir-485-3p | 1398 | 1405 | 1A,M8 | HSA-MIR-485-3P | gucauacgggcucucucucucucu |
mir-544 | 851 | 857 | M8 | HSA-MIR-544 | auucugcauuuuuuagcaagu |
mir-7 | 572 | 578 | 1a | HSA-MIR-7SZ | Uggaagacuaguuuuuguug |
mir-9 | 115 | 122 | 1A,M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |