概括
基因 9706
象征 ULK2
同义词 ATG1B | UNC51.2
描述 UNC-51喜欢自噬激活激活激酶2
参考 MIM:608650|HGNC:HGNC:13480|ENSEMBL:ENSG00000083290|HPRD:10556|Vega:Otthumg00000059511
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p11.2
Pascal P值 0.013
Sherlock P值 0.159
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0048675 轴突扩展 IEA Axon(GO期限:13) -
GO:0048671 附带发芽的负调节 IEA Axon(GO术语级别:15) -
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去:0007165 信号转导 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 艾达 18029348
去:0005730 核仁 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
自噬调节 35 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg mtor信号通路 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MTOR 4 Pathway 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘vmyb的目标 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标8小时DN 129 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤复制编号 181 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时 176 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17P11扩增子 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射8G后的生存率不佳 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射2G后的生存率不佳 171 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUILLETTE CLL 13Q14删除DN 60 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mizushima自噬体形成 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 1474 1480 M8 HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu
mir-124.1 181 187 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 181 187 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-130/301 591 598 1A,M8 HSA-MIR-130A cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-137 2164 2170 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
MiR-200BC/429 910 917 1A,M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-22 1060 1066 M8 HSA-MIR-22 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-26 1215 1222 1A,M8 HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-299-5p 1223 1229 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-323 1077 1083 M8 HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
mir-328 961 968 1A,M8 HSA-MIR-328 cuggcccucugccuuccgu
mir-485-3p 1398 1405 1A,M8 HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu
mir-544 851 857 M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu
mir-7 572 578 1a HSA-MIR-7SZ Uggaagacuaguuuuuguug
mir-9 115 122 1A,M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga