Summary
基因 972
象征 CD74
Synonyms dhlag | hladg | ii | ia-gamma
Description CD74分子
Reference MIM:142790|HGNC:HGNC:1697|Ensembl:ENSG00000019582|HPRD:00825|Vega:Otthumg00000163559
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q32
Pascal P值 0.987
Sherlock p-value 0.247
胎儿β -2.479
主持人 Myers' cis & trans

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 Description 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I Genome scan meta-analysis PSR:0.0032
gsma_iie Genome scan meta-analysis (European-ancestry samples) PSR:0.01718
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) Psr: 0.00459
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
rs12219173 Chr10 68689566 CD74 972 0.09 反式
RS17111364 Chr10 97901813 CD74 972 0.19 反式
rs11216720 Chr11 117909100 CD74 972 0.13 反式
RS12223165 Chr11 117910016 CD74 972 0.13 反式
rs11216730 Chr11 117918701 CD74 972 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FPGS 0.82 0.77
SLC25A1 0.82 0.79
ADCK4 0.82 0.79
GNB2 0.81 0.79
VPS28 0.81 0.77
CPSF3L 0.81 0.76
C7orf27 0.81 0.81
ZNF408 0.81 0.78
MIIP 0.81 0.78
CXXC1 0.80 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.57 -0.63
C5orf53 -0.55 -0.58
AF347015.33 -0.55 -0.62
AF347015.31 -0.53 -0.59
mt-cyb -0.51 -0.59
Rapgef4 -0.50 -0.56
RGS5 -0.50 -0.53
SLCO1A2 -0.50 -0.63
AF347015.8 -0.50 -0.60
PLA2G4A -0.49 -0.55

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0019955 细胞因子结合 IPI 12782713
GO:0042289 MHC class II protein binding IEA -
GO:0042289 MHC class II protein binding nas 10981873
GO:0042802 相同的蛋白质结合 TAS 12782713
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001516 前列腺素生物合成过程 艾达 12782713
去:0006461 protein complex assembly ISS -
GO:0016064 免疫球蛋白介导的免疫反应 ISS -
去:0007165 信号转导 艾达 12782713
GO:0019882 抗原处理和演示 IEA -
GO:0019883 抗原加工和内源性抗原的表现 nas 10981873
GO:0008283 cell proliferation 艾达 12782713
去:0006955 免疫反应 IEA -
去:0006886 细胞内蛋白转运 IEA -
去:0006886 细胞内蛋白转运 ISS -
GO:0043066 凋亡的负调节 艾达 12782713
GO:0043030 巨噬细胞激活的调节 nas 12782713
GO:0045058 T细胞选择 nas 10981873
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 TAS 12782713
去:0016020 membrane IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 TAS 6324166

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
KEGG抗原处理和演示 89 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME MHC CLASS II ANTIGEN PRESENTATION 91 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome免疫系统 933 616 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome适应性免疫系统 539 350 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标 473 314 All SZGR 2.0 genes in this pathway
THUM SYSTOLIC HEART FAILURE UP 423 283 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA UP 1821年 933 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶向D 38 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG DN 45 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
cavard肝癌恶性与良性 32 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mattioli Mgus vs PCL 116 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LUI甲状腺癌簇4 16 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
沙诺田顺铂耐药性DN 51 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔卡拉凋亡 88 60 All SZGR 2.0 genes in this pathway
刘鼻咽癌 70 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori前BI淋巴细胞DN 77 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori大型BII淋巴细胞DN 58 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori未成熟B淋巴细胞向上 53 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori成熟B淋巴细胞向上 90 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iizuka肝癌进展L0 L1 DN 21 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEE LIVER CANCER ACOX1 UP 64 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HBV感染的Wieland 101 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEE LIVER CANCER MYC E2F1 UP 56 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS 882 572 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEE LIVER CANCER E2F1 UP 62 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yu Myc针对DN 55 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lenaour树突状细胞成熟 114 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Greenbaum E2A靶向DN 21 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iglesias E2F目标 151 103 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BASSO CD40 SIGNALING UP 101 76 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hendricks Smarca4靶向DN 53 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
敏锐的回应罗格列酮DN 106 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王顺铂响应和XPC向上 202 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SATO SILENCED BY METHYLATION IN PANCREATIC CANCER 1 419 273 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Han Jnk Singaling DN 39 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MCLACHLAN DENTAL CARIES UP 253 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim LRC3B目标 30 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GAVIN FOXP3 TARGETS CLUSTER P3 160 103 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向 673 430 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53靶向 602 364 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌 973 570 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌正常 476 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞DN 216 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BEIER GLIOMA STEM CELL DN 66 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vilimas Notch1靶向 52 41 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 102 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GOLDRATH ANTIGEN RESPONSE 346 192 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP 107 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ICHIBA GRAFT VERSUS HOST DISEASE 35D UP 131 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nutt GBM与AO胶质瘤 46 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌克拉斯 491 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 70 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHEN METABOLIC SYNDROM NETWORK 1210 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hsiao家政基因 389 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Liu Vav3前列腺致癌作用 89 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Valk AML群集6 33 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
池子侵入性乳腺癌 288 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌后期复发 62 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML带8 21易位 368 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kobayashi EGFR信号24小时 101 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WANG RESPONSE TO GSK3 INHIBITOR SB216763 UP 397 206 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim Glis2靶向 84 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 180 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
寄养KDM1A靶向 266 142 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 All SZGR 2.0 genes in this pathway