基因页：CD79A
Summary？
| 基因 | 973 |
| 象征 | CD79A |
| Synonyms | IGA|MB-1 |
| Description | CD79A分子 |
| Reference | MIM：112205|HGNC：HGNC：1698|ENSEMBL：ENSG00000105369|HPRD：00203|Vega：Otthumg00000182678 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19q13.2 |
| Pascal P值 | 0.301 |
| 胎儿β | -0.294 |
| DMG | 1(# studies) |
| 主持人 | Myers' cis & trans |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 1 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | Beta (dis) | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG11719283 | 19 | 42574717 | CD79A | 8.41E-4 | 10.837 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10994209 | Chr10 | 61877705 | CD79A | 973 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ifitm2 | 0.57 | 0.50 |
| MT2A | 0.56 | 0.44 |
| MT1F | 0.54 | 0.41 |
| cebpd | 0.53 | 0.42 |
| mt1x | 0.52 | 0.43 |
| ifitm3 | 0.52 | 0.48 |
| RARRES3 | 0.52 | 0.39 |
| Trex1 | 0.52 | 0.44 |
| SRGN | 0.52 | 0.43 |
| MT1M | 0.52 | 0.41 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CCDC49 | -0.37 | -0.38 |
| ZNF638 | -0.36 | -0.36 |
| Arid4a | -0.36 | -0.38 |
| ing2 | -0.35 | -0.39 |
| RTF1 | -0.35 | -0.34 |
| USP7 | -0.35 | -0.34 |
| gigyf2 | -0.35 | -0.33 |
| ZNF417 | -0.35 | -0.34 |
| STX3 | -0.35 | -0.35 |
| Hivep3 | -0.34 | -0.37 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004888 | 跨膜受体活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | ISS | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007166 | cell surface receptor linked signal transduction | IEA | - | |
| 去：0006955 | 免疫反应 | IEA | - | |
| 去：0042100 | B细胞增殖 | ISS | - | |
| GO：0030183 | B细胞分化 | ISS | - | |
| GO:0050853 | B细胞受体信号通路 | ISS | - | |
| Cellular component | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0019815 | B cell receptor complex | ISS | 突触（GO期限：8） | - |
| 去：0005771 | 多个身体 | ISS | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0009897 | external side of plasma membrane | ISS | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO:0045121 | 膜筏 | ISS | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AMBP | EDC1 |HCP |Hi30 |iatil |iti |itil |itilc |UTI | α-1-微球蛋白/比库宁前体 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 |
Biogrid | 6196366|9183005 |
| BLK | MGC10442 | B淋巴酪氨酸激酶 | - | HPRD,BioGRID | 7592958 |
| BLNK | bash |blnk-s |Ly57 |MGC111051 |SLP-65 |SLP65 | B细胞链接器 | - | HPRD,BioGRID | 11449366|11909947 |
| CD19 | B4 |MGC12802 | CD19分子 | - | HPRD,BioGRID | 9120258 |
| CD79A | Iga |MB-1 | CD79A分子，免疫球蛋白相关α | - | HPRD | 1881434 |
| CD79B | B29 |IGB | CD79B分子，免疫球蛋白相关β | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12886015 |
| CD79B | B29 |IGB | CD79B分子，免疫球蛋白相关β | - | HPRD | 1591006|8656670 |
| Fanca | fa |FA-H |FA1 |FAA |FACA |法|Fanch |MGC75158 | Fanconi贫血，互补小组A | Two-hybrid | Biogrid | 14499622 |
| FCAR | CD89 | Iga的FC片段，受体 | - | HPRD | 8666916|10438530 |
| HCLS1 | CTTNL | HS1 | 造血细胞特异性LYN底物1 | - | HPRD,BioGRID | 7927516 |
| IGHM | DKFZP686I15196 |DKFZP686I15212 |FLJ00385 |MGC104996 |MGC52291 |Mu |VH | 免疫球蛋白重量常数MU | - | HPRD | 9561918 |
| IGJ | IGCJ |JCH | 免疫球蛋白J多肽，用于免疫球蛋白α和MU多肽的接头蛋白 | - | HPRD | 1292512|8683109 |
| pigr | FLJ22667 |MGC125361 |MGC125362 | polymeric immunoglobulin receptor | - | HPRD | 1940346|7989333 |10540352|12186846 |
| ptprc | B220 |CD45 |CD45R |GP180 |LCA |ly5 |T200 | 蛋白酪氨酸磷酸酶，受体类型，C | - | HPRD,BioGRID | 7516335 |
| Syk | dkfzp313n1010 |FLJ25043 |FLJ37489 | 脾酪氨酸激酶 | - | HPRD,BioGRID | 1569106 | 7500027 |