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概括?

基因ID	9734
Symbol	HDAC9
同义词	HD7\|HD7b\|HD9\|HDAC\|HDAC7\|HDAC7B\|HDAC9B\|HDAC9FL\|HDRP\|MITR
描述	组蛋白脱乙酰基酶9
参考	MIM：606543\|HGNC：HGNC：14065\|Ensembl:ENSG00000048052\|HPRD:05944\|Vega：Otthumg00000152487
基因type	protein-coding
地图位置	7p21.1
Pascal P值	0.255
Fetal beta	0.217
DMG	1（＃研究）
支持	Chromatin Remodeling Genes

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
CV：GWASDB	全基因组关联研究	gwasdbrecords for schizophrenia
简历：PGCNP	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG:Wockner_2014	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24).	1
PMID:cooccur	高通量文献搜索	Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

Differentially methylated gene

探测	Chromosome	Position	Nearest gene	P (dis)	beta（dis）	FDR (dis)	Study
cg24458314	7	18679329	HDAC9	4.266E-4	0.402	0.045	DMG:Wockner_2014

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
SCFD2	0.91	0.89
CD200	0.91	0.91
PSMD2	0.91	0.90
ZDHHC3	0.90	0.89
gorasp2	0.90	0.88
ASB8	0.89	0.88
ALAS1	0.89	0.85
KLHL12	0.89	0.86
trpc4ap	0.89	0.87
RNF41	0.89	0.86

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
MT-CO2	-0.76	-0.72
AF347015.21	-0.76	-0.74
AF347015.8	-0.73	-0.71
AF347015.31	-0.73	-0.70
AF347015.2	-0.72	-0.70
higd1b	-0.72	-0.69
MT-CYB	-0.71	-0.69
AF347015.33	-0.71	-0.69
AF347015.26	-0.71	-0.69
FXYD1	-0.70	-0.72

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
BCL6	bcl5 \|bcl6a \|laz3 \|ZBTB27 \|Znf51	B-cell CLL/lymphoma 6	-	HPRD	12590135
CBX5	HP1 \| HP1A	Chromobox同源物5（HP1 Alpha同源物，果蝇）	-	HPRD，Biogrid	12242305
CTBP1	BARS \| MGC104684	C-terminal binding protein 1	in vitro 体内 Reconstituted Complex 两个杂交	BioGRID	11022042
ETV6	电话\|电话/abl	ETS变体6	Affinity Capture-Western	BioGRID	12590135
HDAC1	DKFZp686H12203 \| GON-10 \| HD1 \| RPD3 \| RPD3L1	组蛋白脱乙酰基酶1	Affinity Capture-Western	BioGRID	10655483
HDAC1	DKFZp686H12203 \| GON-10 \| HD1 \| RPD3 \| RPD3L1	组蛋白脱乙酰基酶1	An unspecified isoform of HDAC9 (MITR) interacts with HDAC1. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between an unspecified isoform of human HDAC9 and HDAC1 from an unspecified species.	BIND	15711539
HDAC1	DKFZp686H12203 \| GON-10 \| HD1 \| RPD3 \| RPD3L1	组蛋白脱乙酰基酶1	-	HPRD	12590135
HDAC3	HD3 \| RPD3 \| RPD3-2	组蛋白脱乙酰基酶3	An unspecified isoform of HDAC9 (MITR) interacts with HDAC3. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between an unspecified isoform of human HDAC9 and HDAC3 from an unspecified species.	BIND	15711539
HDAC3	HD3 \| RPD3 \| RPD3-2	组蛋白脱乙酰基酶3	-	HPRD，Biogrid	10655483
HDAC4	HA6116 \| HD4 \| HDAC-A \| HDACA \| KIAA0288	组蛋白脱乙酰基酶4	-	HPRD，Biogrid	12590135
HEY2	CHF1 \| GRIDLOCK \| GRL \| HERP1 \| HESR2 \| HRT2 \| MGC10720 \| bHLHb32	毛/ enhancer-of-split related with YRPW motif 2	Affinity Capture-Western	BioGRID	11486045
HIST2H3A	H3/n \| H3/o	histone cluster 2, H3a	Biochemical Activity	BioGRID	12590135
Hist4H4	H4/p \| MGC24116	集群组蛋白H4	Biochemical Activity	BioGRID	12590135
MEF2A	ADCAD1 \| RSRFC4 \| RSRFC9	myocyte enhancer factor 2A	Affinity Capture-Western Reconstituted Complex	BioGRID	10487761\|10748098
MEF2A	ADCAD1 \| RSRFC4 \| RSRFC9	myocyte enhancer factor 2A	-	HPRD	10825153
MORF4L2	KIAA0026 \|morfl2 \|mrgx	死亡率因子4像2	Affinity Capture-Western	BioGRID	14506250
NCOR1	KIAA1047 \| MGC104216 \| N-CoR \| TRAC1 \| hCIT529I10 \| hN-CoR	nuclear receptor co-repressor 1	Affinity Capture-Western Reconstituted Complex	BioGRID	12590135
NRIP1	FLJ77253 \|RIP140	核受体相互作用蛋白1	Reconstituted Complex	BioGRID	15060175
SIN3A	DKFZp434K2235 \| FLJ90319 \| KIAA0700	SIN3 homolog A, transcription regulator (yeast)	Affinity Capture-Western Reconstituted Complex	BioGRID	11959865\|12590135
SIN3B	KIAA0700	SIN3 homolog B, transcription regulator (yeast)	Reconstituted Complex	BioGRID	12590135
SUMO1	DAP-1 \| GMP1 \| OFC10 \| PIC1 \| SENP2 \| SMT3 \| SMT3C \| SMT3H3 \| SUMO-1 \| UBL1	SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 1 (S. cerevisiae)	-	HPRD	12590135
SUMO2	HSMT3 \| MGC117191 \| SMT3B \| SMT3H2	SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 2 (S. cerevisiae)	-	HPRD	12590135
SUV39H1	KMT1A \| MG44 \| SUV39H	Variegation 3-9同源1（果蝇）的抑制剂	Affinity Capture-Western Reconstituted Complex	BioGRID	12242305
ZBTB16	PLZF \| ZNF145	锌指和包含16的BTB结构域	-	HPRD	12590135

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
BIOCARTA CARM ER PATHWAY	35	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HDAC CLASSII PATHWAY	34	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HDAC CLASSI PATHWAY	66	50	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NOTCH1 INTRACELLULAR DOMAIN REGULATES TRANSCRIPTION	46	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY NOTCH1	70	46	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY NOTCH	103	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 DN的Hollmann凋亡	267	178	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN	526	357	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LIVE DN	384	220	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS GREEN UP	23	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP	457	269	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向	501	327	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP	722	443	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS DN	781	465	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN	172	112	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS E UP	97	60	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN	164	111	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时	487	286	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SOX2 TARGETS	734	436	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG RESPONSE TO IKK INHIBITOR AND TNF UP	223	140	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN	464	276	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB TARGETS 2	114	76	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BASSO CD40 SIGNALING DN	68	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALAY AML BY NPM1 LOCALIZATION DN	184	132	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HARRIS HYPOXIA	81	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 6HR DN	160	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP	953	554	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时	783	442	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3	160	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZIN EPIGENETIC SILENCING BY KRAS	26	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先	430	288	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN DN	249	165	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE	242	168	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应	315	201	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF DN	235	144	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 UP	408	276	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU VAV3 PROSTATE CARCINOGENESIS UP	89	61	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存	73	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列	351	238	该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine卵泡甲状腺腺瘤	75	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO HEPATOBLASTOMA CLASSES DN	210	141	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3	445	257	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN	115	73	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUBTIL PROGESTIN TARGETS	36	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE EARLY LATE	317	190	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ISSAEVA MLL2 TARGETS	62	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN	1080	713	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG MLL TARGETS	289	188	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 COMPLETE	227	151	该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定	517	302	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL DN	308	187	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY	1839年	928	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：HDAC9