基因页面:IFT140
总结吗?
| GeneID | 9742年 |
| 象征 | IFT140 |
| 同义词 | MZSDS | SRTD9 | WDTC2 | c305C8.4 | c380F5.1 | gs114 |
| 描述 | intraflagellar运输140 |
| 参考 | MIM: 614620|HGNC: HGNC: 29077|运用:ENSG00000187535|HPRD: 11093|织女:OTTHUMG00000128585 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 16 p13.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.864 |
| 胎儿β | 0.343 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| 认为:Xu_2012 | 全外显子组测序分析 | 新创4基因的突变的外显子组测序鉴定了795个样本 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IFT140 | chr16 | 1607967 | C | T | NM_014714 | p.790E > K | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Xu_2012 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg10465839 | 16 | 1584050 | IFT140; TMEM204 | 1.313的军医 | 0.362 | 0.03 | DMG: Wockner_2014 |
| cg08006309 | 16 | 1587810 | IFT140; TMEM204 | 2.733的军医 | 0.409 | 0.038 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| rp11 - 791 g16.2 | 0.88 | 0.89 |
| L3MBTL3 | 0.87 | 0.89 |
| MGEA5 | 0.87 | 0.90 |
| KLF6 | 0.86 | 0.87 |
| SLC44A5 | 0.86 | 0.86 |
| ZBTB8B | 0.85 | 0.81 |
| HMGCS1 | 0.85 | 0.92 |
| 斯通 | 0.85 | 0.89 |
| HMGCR | 0.84 | 0.89 |
| RNF19A | 0.84 | 0.87 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.66 | -0.78 |
| FXYD1 | -0.65 | -0.76 |
| AF347015.27 | -0.64 | -0.75 |
| TSC22D4 | -0.64 | -0.70 |
| MT-CO2 | -0.64 | -0.77 |
| REEP6 | -0.63 | -0.57 |
| AF347015.33 | -0.63 | -0.73 |
| AIFM3 | -0.63 | -0.64 |
| S100B | -0.63 | -0.71 |
| HLA-F | -0.62 | -0.63 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开回应前列腺素E2 DN | 391年 | 222年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 加西亚FLI1和DAX1的目标 | 57 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 16 p13 NIKOLSKY乳腺癌扩增子 | 120年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC目标了 | 317年 | 208年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌基本DN | 701年 | 446年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| POOLA浸润性乳腺癌DN | 134年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |