概括
基因 975
象征 CD81
同义词 CVID6 | S5.7 | TAPA1 | TSPAN28
描述 CD81分子
参考 MIM:186845|HGNC:HGNC:1701|ENSEMBL:ENSG00000110651|HPRD:08924|Vega:Otthumg00000009892
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.5
Pascal P值 0.298
Sherlock P值 0.769
胎儿β -0.622
DMG 2(#研究)
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 6
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 6

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG20321801 11 2404384 CD81 1.46E-5 -0.436 0.015 DMG:Wockner_2014
CG26382697 11 2406712 CD81 2.391E-4 0.46 0.037 DMG:Wockner_2014
CG16465939 11 2554410 CD81 2.19e-5 5.899 DMG:Vaneijk_2014
CG17627559 11 2323896 CD81 8.99e-6 5.499 DMG:Vaneijk_2014
CG05656180 11 2890258 CD81 0.001 4.823 DMG:Vaneijk_2014
CG12949760 11 2542862 CD81 1.54E-5 4.647 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CD19 B4 |MGC12802 CD19分子 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 1383329|7636191
|9804823
CD4 CD4MUT CD4分子 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 7636191
CD46 MCP |MGC26544 |MIC10 |TLX |Tra2.10 CD46分子,补体调节蛋白 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10741407
CD63 LAMP-3 |ME491 |MLA1 |OMA81H |TSPAN30 CD63分子 - HPRD 12036870
CD63 LAMP-3 |ME491 |MLA1 |OMA81H |TSPAN30 CD63分子 体内 Biogrid 9006891
CD81 S5.7 |TAPA1 |TSPAN28 CD81分子 - HPRD,Biogrid 12437138
CD9 5H9 |BA2 |BTCC-1 |DARAP-27 |Gig2 |MIC3 |MRP-1 |p24 |TSPAN29 CD9分子 - HPRD 12036870
CD9 5H9 |BA2 |BTCC-1 |DARAP-27 |Gig2 |MIC3 |MRP-1 |p24 |TSPAN29 CD9分子 亲和力捕获 - 韦斯特恩
共同分级
Biogrid 8630057|9804823
CR2 C3DR |CD21 |SLEB9 补体成分(3D/Epstein Barr病毒)受体2 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 1383329
DLG5 KIAA0583 |LP-DLG |p-dlg5 |PDLG 圆盘,大型同源物5(果蝇) 两个杂交 Biogrid 16169070
ifitm1 9-27 |CD225 |ifi17 |Leu13 干扰素诱导的跨膜蛋白1(9-27) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 2398277
IGSF8 CD316 |CD81P3 |ewi2 |pgrl 免疫球蛋白超家族,成员8 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11673522
INO80B HMGA1L4 |hmgiyl4 |IES2 |PAP-1BP |爸爸1 |Znhit4 |hies2 INO80复合体亚基b 两个杂交 Biogrid 16169070
itga4 CD49D |IA4 |MGC90518 整合素,α4(抗原CD49D,alpha 4的VLA-4受体亚基) - HPRD,Biogrid 10229664
ITGB1 CD29 |fnrb |GPIIA |MDF2 |MSK12 |vla-beta |vlab 整合素,β1(纤连蛋白受体,β多肽,抗原CD29包括MDF2,MSK12) - HPRD,Biogrid 10229664
成套工具 c-kit |CD117 |PBT |scfr V-Kit Hardy-Zuckerman 4猫肉瘤病毒性癌基因同源物 - HPRD,Biogrid 12036870
ptgfrn CD315 |CD9P-1 |ewi-f |FLJ11001 |FPRP |KIAA1436 |SMAP-6 前列腺素F2受体阴性调节剂 亲和力捕获 - 韦斯特恩
体外
体内
Biogrid 11087758|11278880
TSPAN4 nag-2 |nag2 |四翼|TM4SF7 |TSPAN-4 四翼烷蛋白4 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 9360996
ZBTB16 PLZF |ZNF145 锌指和包含16的BTB结构域 两个杂交 Biogrid 16169070


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG B细胞受体信号通路 75 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG BCR信号通路 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Integin1途径 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素A4B1途径 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
淋巴机与非淋巴样细胞之间的反应组免疫调节性相互作用 70 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
唱歌转移基质 110 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Simbulan Parp1靶向 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold脂肪形成DN 64 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张抗病毒对利巴韦林的反应 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zamora NOS2靶向DN 96 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng对H2O2的响应 71 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 77 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein少突胶质细胞 74 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P4 100 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouyang前列腺癌的进展 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HANN对BCL2抑制剂的抗性 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk受精 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 114 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chung水泡细胞毒性 134 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tacker吉西他滨抵抗 79 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRA与基质刺激DN 99 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集9 35 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3目标 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONO AML1目标DN 41 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold对TZD DN的反应 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) 98 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合TOP20 DN的TORCHIA目标 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Brideau印迹基因 63 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
boudoukha由IGF2BP2绑定 111 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因