基因页：ZFYVE16
概括？
| 基因 | 9765 |
| 象征 | ZFYVE16 |
| 同义词 | PPP1R69 |
| 描述 | 锌指fyve型含有16个 |
| 参考 | MIM：608880|HGNC：HGNC：20756|Ensembl：ENSG0000000039319|HPRD：10319|Vega：Otthumg00000108178 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q14 |
| Pascal P值 | 0.802 |
| Sherlock P值 | 0.423 |
| 胎儿β | 0.093 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG25154432 | 5 | 79703725 | ZFYVE16 | 1.12E-9 | -0.01 | 1.24e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10738347 | Chr9 | 13774022 | ZFYVE16 | 9765 | 0.19 | 反式 | ||
| RS7879848 | Chrx | 68139042 | ZFYVE16 | 9765 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ATG9A | 0.90 | 0.90 |
| 达格拉 | 0.90 | 0.91 |
| Zer1 | 0.90 | 0.90 |
| spata2 | 0.90 | 0.88 |
| AC135048.1 | 0.89 | 0.90 |
| RNF157 | 0.89 | 0.89 |
| GPI | 0.88 | 0.86 |
| CACNB1 | 0.88 | 0.85 |
| BAP1 | 0.88 | 0.87 |
| mgat5b | 0.88 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GNG11 | -0.60 | -0.56 |
| AF347015.21 | -0.59 | -0.44 |
| C1orf54 | -0.52 | -0.49 |
| IL32 | -0.51 | -0.44 |
| myl12a | -0.51 | -0.55 |
| AL139819.3 | -0.51 | -0.49 |
| DBI | -0.51 | -0.54 |
| NSBP1 | -0.51 | -0.48 |
| AL050337.1 | -0.51 | -0.53 |
| AF347015.18 | -0.50 | -0.34 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg tgf beta信号通路 | 86 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID BMP途径 | 42 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TGFBR途径 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BMP的Reactome信号传导 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP | 185 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌2小时DN | 88 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX3 FOXO1融合DN的Ebauer目标 | 48 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标DN | 124 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |