基因页:TBC1D5
概括?
基因 | 9779 |
象征 | TBC1D5 |
同义词 | - |
描述 | TBC1域家庭成员5 |
参考 | MIM:615740|HGNC:HGNC:19166|ENSEMBL:ENSG00000131374|HPRD:10262|Vega:Otthumg00000155488 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P24.3 |
Pascal P值 | 1.092E-6 |
胎儿β | -0.128 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TBC1D5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
baz2a | 0.95 | 0.96 |
C2CD3 | 0.94 | 0.95 |
crkrs | 0.94 | 0.96 |
SLC12A6 | 0.93 | 0.95 |
SSH2 | 0.92 | 0.95 |
MFHAS1 | 0.92 | 0.94 |
RAD54L2 | 0.92 | 0.94 |
KIAA0240 | 0.92 | 0.95 |
C14orf21 | 0.92 | 0.92 |
DCP1A | 0.92 | 0.94 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.69 | -0.83 |
MT-CO2 | -0.67 | -0.82 |
FXYD1 | -0.66 | -0.80 |
AF347015.27 | -0.65 | -0.79 |
higd1b | -0.65 | -0.82 |
ifi27 | -0.65 | -0.79 |
C5orf53 | -0.64 | -0.70 |
AF347015.33 | -0.64 | -0.76 |
COPZ2 | -0.64 | -0.72 |
serpinb6 | -0.64 | -0.67 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005097 | RAB GTPase激活剂活性 | IEA | - | |
去:0005096 | GTPase激活剂活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16713569 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0032313 | RAB GTPase活性的调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钟对偶氮丁丁和TSA DN的反应 | 70 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bogni治疗与髓样白血病DN有关 | 33 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPI1和FLI1的Juban目标 | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |