概括
基因 9781
象征 RNF144A
同义词 RNF144 | UBCE7IP4
描述 环手指蛋白144a
参考 HGNC:HGNC:20457|ENSEMBL:ENSG00000151692|HPRD:11510|Vega:Otthumg0000000090353
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P25.2
Pascal P值 0.126
Sherlock P值 0.287
DEG P值 DEG:ZHAO_2015:P = 2.20E-04:Q = 0.0860
胎儿β 0.885
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Zhao_2015 RNA测序分析 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 RNF144A 9781 0.02 反式
RS16955618 CHR15 29937543 RNF144A 9781 0.01 反式
RS1041786 CHR21 22617710 RNF144A 9781 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KDM5B 0.97 0.95
HSDL1 0.96 0.95
CTTNBP2NL 0.96 0.96
C2orf44 0.96 0.93
PRRC1 0.96 0.95
ZNF304 0.96 0.94
RRN3 0.96 0.94
RBM12 0.96 0.95
NUP160 0.96 0.95
C9orf97 0.96 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.72 -0.78
HLA-F -0.71 -0.76
AIFM3 -0.70 -0.76
FBXO2 -0.69 -0.64
pth1r -0.69 -0.72
AF347015.31 -0.68 -0.90
aldoc -0.68 -0.67
AF347015.27 -0.68 -0.89
S100B -0.68 -0.81
TSC22D4 -0.67 -0.76

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ozen mir125b1靶标 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wotton Runx目标DN 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈神经母细胞瘤副本编号收益 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
flt3的大风apl突变 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标DN 120 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂响应和XPC向上 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ehlers非整倍性dn 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5A靶向 217 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因