基因页:RNF144A
概括?
基因 | 9781 |
象征 | RNF144A |
同义词 | RNF144 | UBCE7IP4 |
描述 | 环手指蛋白144a |
参考 | HGNC:HGNC:20457|ENSEMBL:ENSG00000151692|HPRD:11510|Vega:Otthumg0000000090353 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P25.2 |
Pascal P值 | 0.126 |
Sherlock P值 | 0.287 |
DEG P值 | DEG:ZHAO_2015:P = 2.20E-04:Q = 0.0860 |
胎儿β | 0.885 |
主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Zhao_2015 | RNA测序分析 | 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | RNF144A | 9781 | 0.02 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | RNF144A | 9781 | 0.01 | 反式 | ||
RS1041786 | CHR21 | 22617710 | RNF144A | 9781 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KDM5B | 0.97 | 0.95 |
HSDL1 | 0.96 | 0.95 |
CTTNBP2NL | 0.96 | 0.96 |
C2orf44 | 0.96 | 0.93 |
PRRC1 | 0.96 | 0.95 |
ZNF304 | 0.96 | 0.94 |
RRN3 | 0.96 | 0.94 |
RBM12 | 0.96 | 0.95 |
NUP160 | 0.96 | 0.95 |
C9orf97 | 0.96 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.72 | -0.78 |
HLA-F | -0.71 | -0.76 |
AIFM3 | -0.70 | -0.76 |
FBXO2 | -0.69 | -0.64 |
pth1r | -0.69 | -0.72 |
AF347015.31 | -0.68 | -0.90 |
aldoc | -0.68 | -0.67 |
AF347015.27 | -0.68 | -0.89 |
S100B | -0.68 | -0.81 |
TSC22D4 | -0.67 | -0.76 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ozen mir125b1靶标 | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wotton Runx目标DN | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈神经母细胞瘤副本编号收益 | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
flt3的大风apl突变 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1外源目标DN | 120 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂响应和XPC向上 | 202 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ehlers非整倍性dn | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5A靶向 | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |