基因页:SNX17
概括?
基因 | 9784 |
象征 | SNX17 |
同义词 | - |
描述 | 排序Nexin 17 |
参考 | MIM:605963|HGNC:HGNC:14979|ENSEMBL:ENSG00000115234|HPRD:05812|Vega:Otthumg0000000097781 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2p23.3 |
Pascal P值 | 0.001 |
Sherlock P值 | 0.235 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SNX17_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
top2a | 0.98 | 0.82 |
KIF15 | 0.98 | 0.79 |
ASPM | 0.98 | 0.78 |
CASC5 | 0.98 | 0.83 |
cenpf | 0.98 | 0.82 |
MCM10 | 0.97 | 0.79 |
MKI67 | 0.97 | 0.84 |
CKAP2L | 0.97 | 0.78 |
TPX2 | 0.97 | 0.79 |
CDCA7 | 0.97 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FBXO2 | -0.36 | -0.64 |
SLC9A3R2 | -0.36 | -0.43 |
C5orf53 | -0.35 | -0.69 |
HLA-F | -0.35 | -0.69 |
pth1r | -0.35 | -0.66 |
asphd1 | -0.35 | -0.57 |
LHPP | -0.34 | -0.58 |
TNFSF12 | -0.34 | -0.64 |
aldoc | -0.34 | -0.64 |
CA4 | -0.33 | -0.71 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射5的响应5 | 147 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lenaour树突状细胞成熟DN | 128 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng DNA损坏紫外线 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller AML融合的共同靶标 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mellman Tut1靶向 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇2的时间反应2 | 86 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |