概括
基因 9788
象征 MTSS1
同义词 mim | mima | mimb
描述 转移抑制剂1
参考 MIM:608486|HGNC:HGNC:20443|ENSEMBL:ENSG00000170873|HPRD:12243|Vega:Otthumg0000000048189
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p22
Pascal P值 0.069
Sherlock P值 0.31
胎儿β 1.912
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12463686 CHR2 241066951 MTSS1 9788 0.07 反式
RS7567372 CHR2 241069830 MTSS1 9788 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005102 受体结合 IPI 神经递质(GO期限:4) 12570871
去:0003785 肌动蛋白单体结合 艾达 12570871
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0046847 丝状形成 IEA 轴突(GO术语级别:10) -
去:0007399 神经系统的发展 IEA 神经突(GO期限:5) -
去:0007169 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号传导途径 塔斯 12570871
去:0007155 细胞粘附 nas 12570871
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0006928 细胞运动 nas 12570871
去:0030036 肌动蛋白细胞骨架组织 塔斯 12082544
GO:0045786 细胞周期的负调控 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001726 荷叶边 nas 12570871
去:0005737 细胞质 塔斯 12570871
GO:0015629 肌动蛋白细胞骨架 艾达 12570871
去:0030139 内吞囊泡 塔斯 12570871

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID刺猬Gli途径 48 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不良DN 60 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂黑色DN的反应 11 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合粒细胞的tonks目标向上 55 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AML1 MTG8融合DN的DUNNE目标 19 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer肌原靶标 50 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Georges细胞周期miR192目标 62 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON 157 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL与VH重新排列 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗HCMV感染48小时 180 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSADA ASCL1靶向 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
de yy1靶向 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索毛毛细胞白血病DN 80 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱门特乳腺癌复制号码 23 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向成纤维细胞 84 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7靶向1个 194 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir1靶标dn 7 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 66 72 1a HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-103/107 814 820 M8 HSA-MIR-103 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107 agcagcauuguacgggcuauca
mir-135 705 712 1A,M8 HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-141/200a 721 727 M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-15/16/195/424/497 815 821 M8 HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-182 1928年 1935年 1A,M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-23 1950年 1956年 M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-24* 97 104 1A,M8 HSA-MIR-189 Gugccuacugagagauaucagu
mir-28 1674年 1680年 M8 HSA-MIR-28 Aaggagcucacagucuauugag
mir-323 1950年 1956年 1a HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
mir-342 1531年 1537年 1a HSA-MIR-342 ucucacacagaaaucgcacccccguc
mir-370 996 1002 M8 HSA-MIR-370 gccugggggguggaaccugg
mir-381 2114 2121 1A,M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-495 725 731 M8 HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-542-3p 2007 2013 1a HSA-MIR-542-3P ugugacauugauaacugaaa
mir-96 261 268 1A,M8 HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc
HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc