基因页:MTSS1
概括?
基因 | 9788 |
象征 | MTSS1 |
同义词 | mim | mima | mimb |
描述 | 转移抑制剂1 |
参考 | MIM:608486|HGNC:HGNC:20443|ENSEMBL:ENSG00000170873|HPRD:12243|Vega:Otthumg0000000048189 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p22 |
Pascal P值 | 0.069 |
Sherlock P值 | 0.31 |
胎儿β | 1.912 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12463686 | CHR2 | 241066951 | MTSS1 | 9788 | 0.07 | 反式 | ||
RS7567372 | CHR2 | 241069830 | MTSS1 | 9788 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005102 | 受体结合 | IPI | 神经递质(GO期限:4) | 12570871 |
去:0003785 | 肌动蛋白单体结合 | 艾达 | 12570871 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0046847 | 丝状形成 | IEA | 轴突(GO术语级别:10) | - |
去:0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突(GO期限:5) | - |
去:0007169 | 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号传导途径 | 塔斯 | 12570871 | |
去:0007155 | 细胞粘附 | nas | 12570871 | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0006928 | 细胞运动 | nas | 12570871 | |
去:0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | 塔斯 | 12082544 | |
GO:0045786 | 细胞周期的负调控 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001726 | 荷叶边 | nas | 12570871 | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 12570871 | |
GO:0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | 艾达 | 12570871 | |
去:0030139 | 内吞囊泡 | 塔斯 | 12570871 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID刺猬Gli途径 | 48 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN | 169 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不良DN | 60 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂黑色DN的反应 | 11 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 | 157 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合粒细胞的tonks目标向上 | 55 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AML1 MTG8融合DN的DUNNE目标 | 19 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Ebauer肌原靶标 | 50 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Georges细胞周期miR192目标 | 62 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON | 157 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FAELT B CLL与VH重新排列 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OSADA ASCL1靶向 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
de yy1靶向 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索毛毛细胞白血病DN | 80 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 | 126 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克莱门特乳腺癌复制号码 | 23 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 | 91 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hinata NFKB靶向成纤维细胞 | 84 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir1靶标dn | 7 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 66 | 72 | 1a | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-103/107 | 814 | 820 | M8 | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
mir-135 | 705 | 712 | 1A,M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
mir-141/200a | 721 | 727 | M8 | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
mir-15/16/195/424/497 | 815 | 821 | M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
mir-182 | 1928年 | 1935年 | 1A,M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca | ||||
mir-23 | 1950年 | 1956年 | M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-24* | 97 | 104 | 1A,M8 | HSA-MIR-189 | Gugccuacugagagauaucagu |
mir-28 | 1674年 | 1680年 | M8 | HSA-MIR-28脑 | Aaggagcucacagucuauugag |
mir-323 | 1950年 | 1956年 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
mir-342 | 1531年 | 1537年 | 1a | HSA-MIR-342脑 | ucucacacagaaaucgcacccccguc |
mir-370 | 996 | 1002 | M8 | HSA-MIR-370脑 | gccugggggguggaaccugg |
mir-381 | 2114 | 2121 | 1A,M8 | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
mir-495 | 725 | 731 | M8 | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
mir-542-3p | 2007 | 2013 | 1a | HSA-MIR-542-3P | ugugacauugauaacugaaa |
mir-96 | 261 | 268 | 1A,M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |
HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |