基因页面:PTDSS1
总结吗?
GeneID | 9791年 |
象征 | PTDSS1 |
同义词 | LMHD | PSS1 | PSSA |
描述 | 磷脂酰丝氨酸合酶1 |
参考 | MIM: 612792|HGNC: HGNC: 9587|HPRD: 17926| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 8岁的时候 |
帕斯卡假定值 | 0.042 |
夏洛克假定值 | 0.921 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs702697 | chr5 | 56947140 | PTDSS1 | 9791年 | 0.19 | 反式 | ||
rs9548306 | chr13 | 38876011 | PTDSS1 | 9791年 | 0.03 | 反式 | ||
rs6506102 | chr18 | 3277690 | PTDSS1 | 9791年 | 0.01 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PTDSS1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PCDHAC1 | 0.80 | 0.85 |
加 | 0.78 | 0.83 |
PIK3R2 | 0.78 | 0.84 |
SESN2 | 0.78 | 0.80 |
PCDHA13 | 0.78 | 0.83 |
PCDHA5 | 0.77 | 0.84 |
RTN4RL1 | 0.77 | 0.81 |
LRFN2 | 0.77 | 0.82 |
GNAZ | 0.76 | 0.82 |
NFKBIE | 0.76 | 0.82 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.60 | -0.68 |
S100B | -0.59 | -0.66 |
AF347015.33 | -0.59 | -0.65 |
AF347015.31 | -0.58 | -0.66 |
FXYD1 | -0.58 | -0.65 |
MT-CYB | -0.57 | -0.65 |
AC021016.1 | -0.57 | -0.68 |
AF347015.26 | -0.56 | -0.65 |
AP002478.3 | -0.56 | -0.69 |
AF347015.8 | -0.56 | -0.66 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG GLYCEROPHOSPHOLIPID新陈代谢 | 77年 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME磷脂代谢 | 198年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME GLYCEROPHOSPHOLIPID生物合成 | 82年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME代谢脂质和脂蛋白 | 478年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 | 783年 | 507年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHLOSSER MYC目标和血清反应 | 47 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日MYCN放大目标 | 92年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA2 PCC网络 | 423年 | 265年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布伊泰尔特说光动力治疗压力DN | 637年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NIKOLSKY乳腺癌8 q12如扩增子 | 132年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOTTWEIN KSHV米尔K12 11的目标 | 63年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOLDRATH稳态扩散 | 171年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANTVEER乳腺癌转移DN | 121年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
彭雷帕霉素反应DN | 245年 | 154年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MMS小鼠淋巴高4小时 | 36 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KAAB失败心脏心室DN | 41 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 | 393年 | 244年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
年级结肠癌和直肠癌 | 285年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
了吉西他滨抵抗了 | 79年 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧管家基因 | 389年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
开罗肝母细胞癌类了 | 605年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
么时间响应黄体酮集群17 | 181年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 | 682年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
赫希细胞转换签名DN | 103年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |