基因页:Sertad2
概括?
基因 | 9792 |
象征 | Sertad2 |
同义词 | SEI-2 | Trip-Br2 |
描述 | 包含2的serta域 |
参考 | HGNC:HGNC:30784|Ensembl:ENSG00000179833|HPRD:18040|Vega:Otthumg00000152678 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P14 |
Pascal P值 | 0.209 |
Sherlock P值 | 0.03 |
胎儿β | 0.775 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06836181 | 2 | 64995545 | Sertad2 | 1.69E-10 | -0.022 | 5.18e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17126801 | CHR1 | 65098162 | Sertad2 | 9792 | 0.11 | 反式 | ||
SNP_A-1990354 | 0 | Sertad2 | 9792 | 0.2 | 反式 | |||
RS6707117 | CHR2 | 136855504 | Sertad2 | 9792 | 0.04 | 反式 | ||
RS16839796 | CHR4 | 7188348 | Sertad2 | 9792 | 0.02 | 反式 | ||
RS10040715 | CHR5 | 57594207 | Sertad2 | 9792 | 0.06 | 反式 | ||
RS10945911 | CHR6 | 164047509 | Sertad2 | 9792 | 0.13 | 反式 | ||
RS1419793 | CHR7 | 34697630 | Sertad2 | 9792 | 0.2 | 反式 | ||
RS16911034 | Chr11 | 23302320 | Sertad2 | 9792 | 0.13 | 反式 | ||
RS2460047 | Chr11 | 93678935 | Sertad2 | 9792 | 0.12 | 反式 | ||
RS1885073 | CHR14 | 104357181 | Sertad2 | 9792 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LY75 | 0.93 | 0.95 |
PON2 | 0.81 | 0.79 |
add3 | 0.80 | 0.74 |
HRSP12 | 0.80 | 0.77 |
ranbp3l | 0.79 | 0.83 |
TLR3 | 0.78 | 0.76 |
GPC5 | 0.77 | 0.82 |
SDC2 | 0.77 | 0.77 |
NT5E | 0.76 | 0.80 |
PLSCR4 | 0.75 | 0.73 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF821 | -0.58 | -0.66 |
mpp3 | -0.57 | -0.65 |
KIAA1543 | -0.57 | -0.64 |
PODXL2 | -0.57 | -0.65 |
DBN1 | -0.56 | -0.63 |
FAM40A | -0.56 | -0.63 |
ankrd13b | -0.56 | -0.64 |
CSNK1E | -0.56 | -0.62 |
DPF1 | -0.56 | -0.64 |
axin1 | -0.56 | -0.63 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向8小时 | 164 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IGF1和IGF2的Pacher靶标 | 35 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 | 142 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Georges细胞周期miR192目标 | 62 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tavor Cebpa靶向 | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦响应集群D3 | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |