概括
基因 9792
象征 Sertad2
同义词 SEI-2 | Trip-Br2
描述 包含2的serta域
参考 HGNC:HGNC:30784|Ensembl:ENSG00000179833|HPRD:18040|Vega:Otthumg00000152678
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P14
Pascal P值 0.209
Sherlock P值 0.03
胎儿β 0.775
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06836181 2 64995545 Sertad2 1.69E-10 -0.022 5.18e-7 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17126801 CHR1 65098162 Sertad2 9792 0.11 反式
SNP_A-1990354 0 Sertad2 9792 0.2 反式
RS6707117 CHR2 136855504 Sertad2 9792 0.04 反式
RS16839796 CHR4 7188348 Sertad2 9792 0.02 反式
RS10040715 CHR5 57594207 Sertad2 9792 0.06 反式
RS10945911 CHR6 164047509 Sertad2 9792 0.13 反式
RS1419793 CHR7 34697630 Sertad2 9792 0.2 反式
RS16911034 Chr11 23302320 Sertad2 9792 0.13 反式
RS2460047 Chr11 93678935 Sertad2 9792 0.12 反式
RS1885073 CHR14 104357181 Sertad2 9792 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LY75 0.93 0.95
PON2 0.81 0.79
add3 0.80 0.74
HRSP12 0.80 0.77
ranbp3l 0.79 0.83
TLR3 0.78 0.76
GPC5 0.77 0.82
SDC2 0.77 0.77
NT5E 0.76 0.80
PLSCR4 0.75 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF821 -0.58 -0.66
mpp3 -0.57 -0.65
KIAA1543 -0.57 -0.64
PODXL2 -0.57 -0.65
DBN1 -0.56 -0.63
FAM40A -0.56 -0.63
ankrd13b -0.56 -0.64
CSNK1E -0.56 -0.62
DPF1 -0.56 -0.64
axin1 -0.56 -0.63

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向8小时 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGF1和IGF2的Pacher靶标 35 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Georges细胞周期miR192目标 62 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tavor Cebpa靶向 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦响应集群D3 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与T 9 11易位 130 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因