基因页:CKAP5
概括?
基因 | 9793 |
象征 | CKAP5 |
同义词 | chtog | msps | tog | togp | ch-tog |
描述 | 细胞骨架相关蛋白5 |
参考 | MIM:611142|HGNC:HGNC:28959|ENSEMBL:ENSG00000175216|HPRD:10830|Vega:Otthumg00000166599 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P11.2 |
Pascal P值 | 3.985e-6 |
Sherlock P值 | 0.586 |
胎儿β | 0.034 |
支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:Phewas | 全球整个关联研究(PHEWAS) | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1007738 | 11 | 46849360 | 无效的 | 1.503 | CKAP5 | 无效的 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CKAP5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
VPS37A | 0.91 | 0.90 |
SLC30A5 | 0.91 | 0.91 |
TSN | 0.91 | 0.91 |
TBC1D23 | 0.91 | 0.92 |
yme1l1 | 0.90 | 0.91 |
ZC3H14 | 0.90 | 0.91 |
TXNDC16 | 0.90 | 0.92 |
NUP133 | 0.90 | 0.92 |
CNOT7 | 0.90 | 0.91 |
MAP3K7 | 0.90 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.79 | -0.81 |
AF347015.8 | -0.77 | -0.80 |
mt-cyb | -0.76 | -0.78 |
AF347015.31 | -0.76 | -0.79 |
AF347015.33 | -0.75 | -0.77 |
FXYD1 | -0.75 | -0.79 |
AF347015.21 | -0.75 | -0.78 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.77 |
AF347015.15 | -0.73 | -0.78 |
AF347015.2 | -0.73 | -0.76 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID幼稚园 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid aurora a通道 | 31 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome募集有丝分裂的中心体蛋白和复合物 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
来自有丝分裂中心体NLP的反应组损失 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome有丝分裂M M G1相 | 172 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome有丝分裂G2 G2 M相 | 81 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA复制 | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组有丝分裂起点 | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP | 117 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori未成熟B淋巴细胞DN | 90 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
老化老式的DN | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C5的反应 | 46 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应13 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |