概括
基因 9793
象征 CKAP5
同义词 chtog | msps | tog | togp | ch-tog
描述 细胞骨架相关蛋白5
参考 MIM:611142|HGNC:HGNC:28959|ENSEMBL:ENSG00000175216|HPRD:10830|Vega:Otthumg00000166599
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P11.2
Pascal P值 3.985e-6
Sherlock P值 0.586
胎儿β 0.034
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS1007738 11 46849360 无效的 1.503 CKAP5 无效的


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
VPS37A 0.91 0.90
SLC30A5 0.91 0.91
TSN 0.91 0.91
TBC1D23 0.91 0.92
yme1l1 0.90 0.91
ZC3H14 0.90 0.91
TXNDC16 0.90 0.92
NUP133 0.90 0.92
CNOT7 0.90 0.91
MAP3K7 0.90 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.79 -0.81
AF347015.8 -0.77 -0.80
mt-cyb -0.76 -0.78
AF347015.31 -0.76 -0.79
AF347015.33 -0.75 -0.77
FXYD1 -0.75 -0.79
AF347015.21 -0.75 -0.78
AF347015.27 -0.74 -0.77
AF347015.15 -0.73 -0.78
AF347015.2 -0.73 -0.76

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID幼稚园 45 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid aurora a通道 31 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome募集有丝分裂的中心体蛋白和复合物 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
来自有丝分裂中心体NLP的反应组损失 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂M M G1相 172 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂G2 G2 M相 81 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA复制 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组有丝分裂起点 87 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤副本编号 100 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori未成熟B淋巴细胞DN 90 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
老化老式的DN 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C5的反应 46 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36小时DN 185 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常老化DN 225 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应13 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因