基因页面:SCRN1

总结吗?
GeneID 9805年
象征 SCRN1
同义词 SES1
描述 secernin 1
参考 MIM: 614965|HGNC: HGNC: 22192|运用:ENSG00000136193|HPRD: 15304|织女:OTTHUMG00000097093
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 7 p14.3
帕斯卡假定值 0.094
夏洛克假定值 0.293
这样假定值 0.01
胎儿β -0.857
DMG 1(#研究)
eGene 额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和反式
支持 胞外分泌
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
CompositeSet

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
SCRN1 chr7 29976179 G T NM_001145513
NM_001145514
NM_001145515
NM_014766		 p.300P > T
p.320P > T
p.232P > T
p.300P > T		 错义
错义
错义
错义		 精神分裂症 认为:Fromer_2014

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg02076755 7 30028890 SCRN1 3.44 e-9 -0.01 2.26 e-6 DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs320101 chr7 29101890 SCRN1 9805年 0.18 独联体
rs17648790 chr16 7479949 SCRN1 9805年 0.2 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
TFDP2 0.84 0.64
LIMD1 0.82 0.66
NCAPD2 0.82 0.67
RACGAP1P 0.81 0.69
CLSPN 0.81 0.66
SOX6 0.81 0.69
CDCA7 0.81 0.64
KIF14 0.80 0.61
CENPI 0.80 0.60
PRR11 0.80 0.61
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.47 -0.69
FXYD1 -0.46 -0.67
MT-CO2 -0.46 -0.67
HIGD1B -0.46 -0.69
AF347015.33 -0.45 -0.64
IFI27 -0.44 -0.64
MT-CYB -0.44 -0.64
C5orf53 -0.44 -0.59
AF347015.8 -0.43 -0.65
COX4I2 -0.43 -0.60

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
刘前列腺癌DN 481年 290年 所有SZGR 2.0基因通路
GAZDA钻石BLACKFAN贫血红细胞 25 18 所有SZGR 2.0基因通路
CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN 663年 425年 所有SZGR 2.0基因通路
MULLIGHAN NPM1突变签名1 DN 126年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
MULLIGHAN NPM1签名3 DN 162年 116年 所有SZGR 2.0基因通路
JAATINEN造血干细胞 316年 190年 所有SZGR 2.0基因通路
多德鼻咽癌起来 1821年 933年 所有SZGR 2.0基因通路
DN GOZGIT ESR1目标 781年 465年 所有SZGR 2.0基因通路
PROVENZANI转移DN 136年 94年 所有SZGR 2.0基因通路
MARTORIATI MDM4目标神经上皮DN 164年 111年 所有SZGR 2.0基因通路
汤姆林前列腺癌DN 40 33 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN NIPP1目标 848年 527年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH速度的目标 1062年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
唱转移基质DN 54 34 所有SZGR 2.0基因通路
克莱恩主要积液淋巴瘤DN 58 42 所有SZGR 2.0基因通路
FAELT B CLL VH重组 48 34 所有SZGR 2.0基因通路
李肿瘤对胎儿肾脏1 DN 163年 115年 所有SZGR 2.0基因通路
LENAOUR树突状细胞成熟 114年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
VERHAAK AML NPM1突变的DN 246年 180年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML外事局标记 191年 131年 所有SZGR 2.0基因通路
FAELT B CLL VH3 21 DN 49 29日 所有SZGR 2.0基因通路
对紫外线C8 SESTO回应 72年 56 所有SZGR 2.0基因通路
BAELDE糖尿病肾病DN 434年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
安倍VEGFA目标30分钟 29日 21 所有SZGR 2.0基因通路
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃避DN 373年 196年 所有SZGR 2.0基因通路
BOQUEST干细胞起 260年 174年 所有SZGR 2.0基因通路
中村转移 47 28 所有SZGR 2.0基因通路
李早期T淋巴细胞 107年 59 所有SZGR 2.0基因通路
SHEDDEN肺癌好生存A4 196年 124年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和T 8 21易位 368年 247年 所有SZGR 2.0基因通路
金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 682年 440年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍CALB1 CORR 548年 370年 所有SZGR 2.0基因通路
gabriele MIR21目标 289年 187年 所有SZGR 2.0基因通路
李BMP2目标了 745年 475年 所有SZGR 2.0基因通路
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 824年 528年 所有SZGR 2.0基因通路
DN FORTSCHEGGER PHF8目标 784年 464年 所有SZGR 2.0基因通路
KUMAR病原体负载由巨噬细胞 275年 155年 所有SZGR 2.0基因通路