基因页：spock2

概括？
基因 9806
象征 spock2
同义词 Testican-2
描述 Sparc/osteoctin，CWCV和Kazal样域蛋白聚糖（睾丸）2
参考 MIM：607988|HGNC：HGNC：13564|ENSEMBL：ENSG00000107742|HPRD：12146|Vega：Otthumg0000000018430
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10pter-Q25.3
Pascal P值 0.034
Sherlock P值 0.015
胎儿β -3.603
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球
小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG09661010 10 73848153 spock2 3.45e-8 -0.013 1.02E-5 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Cul1 0.95 0.95
clpx 0.94 0.94
FBXO11 0.93 0.95
strn3 0.93 0.94
ZC3H14 0.93 0.94
Cul3 0.93 0.94
yme1l1 0.92 0.94
FBXO38 0.92 0.92
elp3 0.92 0.91
LSG1 0.92 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.82 -0.85
AF347015.31 -0.81 -0.84
ifi27 -0.79 -0.84
AF347015.21 -0.79 -0.82
higd1b -0.78 -0.81
mt-cyb -0.78 -0.80
AF347015.8 -0.78 -0.82
FXYD1 -0.77 -0.82
AF347015.33 -0.77 -0.80
AF347015.27 -0.76 -0.80

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005509 钙离子结合 艾达 10386950
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007416 突触发生 nas 突触（GO期限：6） 10386950
去：0030198 细胞外基质组织 nas 10386950
GO：0045595 细胞分化调节 nas 10386950
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 IEA -
去：0005578 蛋白质的细胞外基质 nas 10386950

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PAX FOXO1融合DN的Davicioni目标DN 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标8小时DN 129 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kang lith pdgfra up 50 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 83 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对伏硫嘌呤DN的反应 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL融合一起 87 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦卡因可卡因奖励5D 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhang GATA6靶向DN 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇7的时间反应7 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA蛋白聚糖 35 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 2925 2931 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-141/200a 3484 3490 1a HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-142-5p 3712 3719 1A，M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-26 2168 2175 1A，M8 HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-543 3681 3687 1a HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu