基因页:spata2
概括?
基因 | 9825 |
象征 | spata2 |
同义词 | PD1 | PPP1R145 | TAMO |
描述 | 精子发生相关2 |
参考 | MIM:607662|HGNC:HGNC:14681|ENSEMBL:ENSG00000158480|HPRD:09636|Vega:Otthumg0000000032704 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20q13.13 |
Pascal P值 | 0.302 |
Sherlock P值 | 0.378 |
胎儿β | -0.703 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13210512 | 20 | 48531577 | spata2 | -0.025 | 0.8 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SPATA2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AFF4 | 0.97 | 0.98 |
LATS1 | 0.97 | 0.97 |
DDX6 | 0.96 | 0.97 |
NCOA3 | 0.96 | 0.97 |
RC3H2 | 0.96 | 0.98 |
IREB2 | 0.96 | 0.96 |
PUM2 | 0.96 | 0.97 |
ZNF518B | 0.95 | 0.97 |
prkdc | 0.95 | 0.97 |
PDS5A | 0.95 | 0.97 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.69 | -0.84 |
AF347015.31 | -0.69 | -0.83 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.84 |
ifi27 | -0.67 | -0.81 |
AIFM3 | -0.67 | -0.71 |
AF347015.33 | -0.66 | -0.79 |
higd1b | -0.66 | -0.83 |
HSD17B14 | -0.66 | -0.75 |
AF347015.27 | -0.66 | -0.79 |
S100B | -0.66 | -0.77 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌6小时DN | 167 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon | 149 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman vincristine抗性B | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman Vincristine抗性全部 | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |