基因页：DNAJC6
Summary？
| 基因ID | 9829 |
| 象征 | DNAJC6 |
| 同义词 | DJC6 | Park19 |
| 描述 | DNAJ热休克蛋白家族（HSP40）成员C6 |
| 参考 | MIM：608375|HGNC：HGNC：15469|Ensembl：ENSG00000116675|HPRD：16326|Vega：Otthumg00000009066 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p31.3 |
| Pascal P值 | 0.891 |
| 胎儿β | -1.004 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | RNA和蛋白质合成 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP CompositeSet Darnell FMRP目标 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| 认为:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02692 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | Sift | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DNAJC6 | CHR1 | 65858354 | C | t | NM_001256864 NM_001256865 NM_014787 |
p.570p> l p.500p> l p.513P>L |
错过 错过 错过 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG07027116 | 1 | 65731738 | DNAJC6 | 3.57E-9 | -0.016 | 2.32E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6902872 | CHR6 | 135087022 | DNAJC6 | 9829 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| STX10 | 0.84 | 0.76 |
| C1orf35 | 0.82 | 0.73 |
| qtrt1 | 0.82 | 0.76 |
| ZBTB48 | 0.82 | 0.76 |
| RP3-402G11.1 | 0.80 | 0.72 |
| Rhot2 | 0.80 | 0.77 |
| FAM113A | 0.80 | 0.70 |
| WDR85 | 0.80 | 0.72 |
| TRMT1 | 0.79 | 0.73 |
| ZGPAT | 0.79 | 0.75 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.50 | -0.49 |
| AF347015.27 | -0.49 | -0.50 |
| MT-CO2 | -0.48 | -0.48 |
| mt-cyb | -0.48 | -0.48 |
| AF347015.21 | -0.48 | -0.53 |
| AF347015.33 | -0.47 | -0.47 |
| AF347015.8 | -0.46 | -0.46 |
| TM4SF18 | -0.44 | -0.45 |
| AF347015.9 | -0.44 | -0.48 |
| AF347015.15 | -0.44 | -0.46 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0004725 | 蛋白酪氨酸磷酸酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
| GO:0017124 | SH3域结合 | IEA | - | |
| GO：0031072 | 热激蛋白结合 | IEA | - |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-219 | 1462 | 1469 | 1A，M8 | HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu |
| mir-23 | 1763年 | 1769年 | M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
| mir-323 | 1763年 | 1769年 | 1a | HSA-MIR-323脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir-342 | 1765年 | 1771年 | 1a | hsa-miR-342脑 | ucucacacagaaaucgcacccccguc |
| mir-369-3p | 1711年 | 1718年 | 1A，M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
| miR-377 | 1819年 | 1826年 | 1A，M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |