基因页：LCMT2
概括？
| 基因 | 9836 |
| 象征 | LCMT2 |
| 同义词 | ppm2 | tyw4 |
| 描述 | 亮氨酸羧甲基转移酶2 |
| 参考 | MIM：611246|HGNC：HGNC：17558|HPRD：17267| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q15.3 |
| Pascal P值 | 0.001 |
| 胎儿beta | 1.125 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136例对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG25415508 | 15 | 43622652 | LCMT2 | 6.06e-9 | -0.011 | 3.22E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共同表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FAM117B | 0.94 | 0.96 |
| asxl3 | 0.93 | 0.94 |
| FAT4 | 0.93 | 0.90 |
| CEP170 | 0.93 | 0.96 |
| EML1 | 0.93 | 0.95 |
| vash2 | 0.92 | 0.87 |
| Tnik | 0.92 | 0.84 |
| MED13L | 0.92 | 0.95 |
| FAM59A | 0.92 | 0.91 |
| DAB1 | 0.92 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| serpinb6 | -0.68 | -0.76 |
| hepn1 | -0.66 | -0.78 |
| HSD17B14 | -0.66 | -0.82 |
| TSC22D4 | -0.66 | -0.83 |
| AIFM3 | -0.66 | -0.79 |
| C5orf53 | -0.65 | -0.77 |
| AF347015.31 | -0.65 | -0.91 |
| HLA-F | -0.65 | -0.77 |
| S100B | -0.64 | -0.86 |
| LHPP | -0.64 | -0.63 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg组氨酸代谢 | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg酪氨酸代谢 | 42 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KeGG Selenoamino酸代谢 | 26 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 沙诺田顺铂抵抗DN | 51 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |