基因页:Elmo1
概括?
基因 | 9844 |
象征 | Elmo1 |
同义词 | Ced-12 | Ced12 | Elmo-1 |
描述 | 吞噬和细胞运动1 |
参考 | MIM:606420|HGNC:HGNC:16286|ENSEMBL:ENSG00000155849|HPRD:12102|Vega:Otthumg0000000023701 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p14.1 |
Pascal P值 | 0.205 |
Sherlock P值 | 0.975 |
DEG P值 | DEG:Maycox_2009:cc_ba10_fold_change = -1.12:cc_ba10_disease_p = 0.0190:hbb_ba9_fold_change = -1.26:hbb_ba9_disease_p = 0.0340 |
胎儿β | -1.487 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Maycox_2009 | 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 | 我们包括了51个基因,其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1578978 | CHR8 | 118196802 | Elmo1 | 9844 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ELMO1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tcerg1 | 0.93 | 0.94 |
ZNF251 | 0.92 | 0.93 |
ZC3H11A | 0.92 | 0.95 |
KIAA0907 | 0.92 | 0.93 |
PRPF3 | 0.92 | 0.93 |
FNBP4 | 0.92 | 0.93 |
ZFC3H1 | 0.92 | 0.93 |
CCNL1 | 0.91 | 0.90 |
C21orf66 | 0.91 | 0.92 |
ZNF528 | 0.91 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.73 | -0.85 |
ifi27 | -0.72 | -0.86 |
MT-CO2 | -0.70 | -0.83 |
AF347015.27 | -0.70 | -0.82 |
higd1b | -0.70 | -0.85 |
FXYD1 | -0.68 | -0.82 |
AIFM3 | -0.68 | -0.75 |
mt-cyb | -0.67 | -0.79 |
rras | -0.67 | -0.81 |
AF347015.8 | -0.67 | -0.81 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG趋化因子信号传导途径 | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Netrin途径 | 32 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TRKR途径 | 62 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL8 CXCR2途径 | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Rac1 Reg Pathway | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FAK PATHWAY | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NEF在HIV1复制和疾病发病机理中的作用 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bilban b cll lpl up | 63 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧素DN的浓凋亡 | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合目标G DN | 35 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mahadevan GIST形态开关 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI甲状腺癌簇2 | 42 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 2 Up | 64 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lei Hoxc8靶向DN | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 97 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nutt GBM与AO Glioma DN | 45 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi缺氧 | 140 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert核心少突胶质细胞分化 | 40 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir30目标 | 116 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |