概括
基因 9844
象征 Elmo1
同义词 Ced-12 | Ced12 | Elmo-1
描述 吞噬和细胞运动1
参考 MIM:606420|HGNC:HGNC:16286|ENSEMBL:ENSG00000155849|HPRD:12102|Vega:Otthumg0000000023701
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p14.1
Pascal P值 0.205
Sherlock P值 0.975
DEG P值 DEG:Maycox_2009:cc_ba10_fold_change = -1.12:cc_ba10_disease_p = 0.0190:hbb_ba9_fold_change = -1.26:hbb_ba9_disease_p = 0.0340
胎儿β -1.487
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Maycox_2009 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 我们包括了51个基因,其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1578978 CHR8 118196802 Elmo1 9844 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
tcerg1 0.93 0.94
ZNF251 0.92 0.93
ZC3H11A 0.92 0.95
KIAA0907 0.92 0.93
PRPF3 0.92 0.93
FNBP4 0.92 0.93
ZFC3H1 0.92 0.93
CCNL1 0.91 0.90
C21orf66 0.91 0.92
ZNF528 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.73 -0.85
ifi27 -0.72 -0.86
MT-CO2 -0.70 -0.83
AF347015.27 -0.70 -0.82
higd1b -0.70 -0.85
FXYD1 -0.68 -0.82
AIFM3 -0.68 -0.75
mt-cyb -0.67 -0.79
rras -0.67 -0.81
AF347015.8 -0.67 -0.81

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG趋化因子信号传导途径 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Netrin途径 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRKR途径 62 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL8 CXCR2途径 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Rac1 Reg Pathway 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAK PATHWAY 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV感染 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NEF在HIV1复制和疾病发病机理中的作用 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bilban b cll lpl up 63 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧素DN的浓凋亡 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合目标G DN 35 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mahadevan GIST形态开关 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤副本编号 100 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌簇2 42 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 2 Up 64 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lei Hoxc8靶向DN 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭葡萄糖剥夺DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 97 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 196 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kondo EZH2目标 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nutt GBM与AO Glioma DN 45 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 206 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi缺氧 140 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert核心少突胶质细胞分化 40 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir30目标 116 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因