基因页：GAB2
概括？
| 基因 | 9846 |
| 象征 | GAB2 |
| 同义词 | - |
| 描述 | GRB2相关的结合蛋白2 |
| 参考 | MIM：606203|HGNC：HGNC：14458|Ensembl：ENSG0000000033327|HPRD：05866|Vega：Otthumg00000166673 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11q14.1 |
| Pascal P值 | 0.022 |
| Sherlock P值 | 0.739 |
| 胎儿β | 0.76 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24769381 | 11 | 78052863 | GAB2 | 2.254e-4 | -1.472 | 0.036 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16971302 | CHR15 | 80032326 | GAB2 | 9846 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PCNX | 0.95 | 0.97 |
| crkrs | 0.95 | 0.96 |
| Huwe1 | 0.94 | 0.94 |
| Ankrd17 | 0.94 | 0.95 |
| kif1b | 0.94 | 0.96 |
| KIAA0240 | 0.94 | 0.96 |
| 儿子 | 0.94 | 0.93 |
| SSH2 | 0.93 | 0.95 |
| polr1a | 0.93 | 0.94 |
| HERC1 | 0.93 | 0.94 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.81 |
| FXYD1 | -0.71 | -0.79 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.80 |
| higd1b | -0.70 | -0.81 |
| ifi27 | -0.70 | -0.79 |
| S100A16 | -0.68 | -0.76 |
| AF347015.21 | -0.68 | -0.84 |
| CST3 | -0.67 | -0.78 |
| HSD17B14 | -0.67 | -0.73 |
| AF347015.27 | -0.67 | -0.76 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AKT1 | akt |MGC99656 |PKB |pkb-alpha |Prkba |RAC |Rac-Alpha | V-Akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源1 | - | HPRD，Biogrid | 11782427 |
| BCR | 全部|BCR-ABL1 |BCR1 |CML |D22S11 |D22S662 |FLJ16453 |phl | 断点群集区域 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15143164 |
| CD247 | CD3-Zeta |CD3H |CD3Q |CD3Z |T3z |TCRZ | CD247分子 | - | HPRD，Biogrid | 11572860 |
| CRKL | - | V-CRK肉瘤病毒CT10癌基因同源物（Avian）类似 | - | HPRD，Biogrid | 11334882 |
| E2F1 | E2F-1 |RBAP1 |rbbp3 |rbp3 | E2F转录因子1 | GAB2启动子区域与E2F1相互作用。 | 绑定 | 15574337 |
| E2F2 | E2F-2 | E2F转录因子2 | GAB2启动子区域与E2F2相互作用。 | 绑定 | 15574337 |
| E2F3 | DKFZP686C18211 |E2F-3 |KIAA0075 |MGC104598 | E2F转录因子3 | GAB2启动子区域与E2F3相互作用。 | 绑定 | 15574337 |
| epor | MGC138358 | 红细胞生成素受体 | - | HPRD | 10455108 |
| ETV6 | 电话|电话/abl | ETS变体6 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15143164 |
| 抓钩 | MGC64880 | 与GRB2相关的衔接蛋白 | 重构的复合物 | Biogrid | 10391903 |
| grap2 | gads |grap-2 |grb2l |grblg |网格|grpl |grbx |grf40 |蒙娜|p38 | 与GRB2相关的衔接蛋白2 | - | HPRD | 11997510 |
| GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 10391903|11782427 |15143164 |
| GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | - | HPRD | 10068651|11882361 |
| 拉特 | lat1 |pp36 | 激活T细胞的接头 | - | HPRD，Biogrid | 11572860 |
| 林恩 | FLJ26625 |JTK8 | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 | - | HPRD，Biogrid | 11971018 |
| NCK1 | MGC12668 |NCK |nckalpha | NCK适配器蛋白1 | 重构的复合物 | Biogrid | 10391903 |
| PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶，调节亚基1（alpha） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 11334882|11782427 |
| PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶，调节亚基1（alpha） | - | HPRD | 10068651 |
| PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | 磷脂酶C，伽马1 | 重构的复合物 | Biogrid | 10391903 |
| PLCG2 | - | 磷脂酶C，伽马2（磷脂酰肌醇特异性） | - | HPRD，Biogrid | 12135708 |
| PTPN11 | bptp3 |CFC |MGC14433 |NS1 |PTP-1D |PTP2C |SH-PTP2 |sh-ptp3 |SHP2 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体11型 | - | HPRD | 10068651|11287610 |
| PTPN11 | bptp3 |CFC |MGC14433 |NS1 |PTP-1D |PTP2C |SH-PTP2 |sh-ptp3 |SHP2 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体11型 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 10391903|11334882 |11782427|12135708 |
| PTPN6 | HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体6型 | - | HPRD，Biogrid | 11895767 |
| RICS | GC-GAP |砂砾|KIAA0712 |MGC1892 |P200RHOGAP |P250GAP | Rho GTPase激活蛋白 | GAB2与GC-GAP相互作用。 | 绑定 | 12819203 |
| RICS | GC-GAP |砂砾|KIAA0712 |MGC1892 |P200RHOGAP |P250GAP | Rho GTPase激活蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 12819203 |
| SHC1 | FLJ26504 |SHC |SHCA | SHC（SRC同源性2结构域）转化蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11782427|12135708 |
| src | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | V-SRC肉瘤（Schmidt-Ruppin A-2）病毒癌基因同源物（Avian） | - | HPRD，Biogrid | 10391903 |
| ZAP70 | FLJ17670 |FLJ17679 |SRK |std |tzk |ZAP-70 | Zeta链（TCR）相关蛋白激酶70KDA | - | HPRD，Biogrid | 11572860 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg fc epsilon ri信号传导途径 | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg fc伽马r介导的吞噬作用 | 97 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG慢性髓细胞性白血病 | 73 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID FCER1途径 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID GMCSF途径 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TCR途径 | 66 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID遇到了路径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID SHP2途径 | 58 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL2 1 Pathway | 55 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL2 PI3K途径 | 34 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL3途径 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL6 7途径 | 47 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TRKR途径 | 62 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL2 STAT5途径 | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SCF套件的Reactome信号传导 | 78 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FGFR在疾病中的反应组信号传导 | 127 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FGFR1突变体的反应组信号传导 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FGFR1融合突变体的反应组信号传导 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FGFR突变体的Reactome信号传导 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ILS的Reactome信号传导 | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome IL 3 5和GM CSF信号传导 | 43 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome IL受体SHC信号传导 | 27 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome IL 2信号传导 | 41 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌2小时DN | 88 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌6小时DN | 167 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大目标DN | 97 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon | 158 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| podar对Apaphostin的反应 | 147 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利伪虫 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足趋化趋化性 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍夫曼时钟目标DN | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |