基因页：magi2
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| 基因ID | 9863 |
| Symbol | magi2 |
| 同义词 | acvrip1 | aip-1 | aip1 | arip1 | magi-2 | sscam |
| 描述 | 膜相关的鸟苷酸激酶，WW和PDZ结构域，含有2个 |
| 参考 | MIM：606382|HGNC：HGNC：18957|ENSEMBL：ENSG00000187391|HPRD：16212|Vega：Otthumg00000130697 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7q21 |
| 胎儿β | 0.238 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 支持 | CompositeSet Darnell FMRP目标 潜在的突触基因 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 3 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008), association studies | 3 | 链接到Szgene |
| Literature | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg13051700 | 7 | 79050007 | magi2 | 8.29e-5 | -0.549 | 0.026 | DMG：Wockner_2014 |
| CG06809544 | 7 | 79081666 | magi2 | 1.19e-8 | -0.013 | 4.92E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG05270344 | 7 | 79083635 | magi2 | 1E-7 | -0.007 | 2.21E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| POLR2C | 0.90 | 0.88 |
| CIAO1 | 0.88 | 0.87 |
| PRPF19 | 0.85 | 0.85 |
| TMed4 | 0.85 | 0.82 |
| KLHL12 | 0.84 | 0.83 |
| 毒剂 | 0.84 | 0.82 |
| C1orf109 | 0.83 | 0.81 |
| Surf4 | 0.83 | 0.82 |
| PI4KB | 0.83 | 0.81 |
| CNBP | 0.83 | 0.82 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.8 | -0.65 | -0.63 |
| AF347015.21 | -0.65 | -0.64 |
| MT-CO2 | -0.65 | -0.61 |
| AF347015.26 | -0.63 | -0.61 |
| MT-CYB | -0.63 | -0.61 |
| AF347015.31 | -0.63 | -0.60 |
| AF347015.18 | -0.62 | -0.70 |
| AF347015.2 | -0.62 | -0.56 |
| AF347015.15 | -0.62 | -0.60 |
| AF347015.33 | -0.61 | -0.58 |
第三节。基因本体论注释
| Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 9647693 | |
| GO：0019902 | phosphatase binding | IPI | 10760291 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0019717 | synaptosome | IEA | Synap, Brain (GO term level: 7) | - |
| GO:0045202 | synapse | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0030054 | cell junction | IEA | - |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| miRNA family | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-1/206 | 2025 | 2031 | 1a | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
| hsa-miR-206SZ | UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG | ||||
| HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
| mir-101 | 1858年 | 1865年 | 1A，M8 | HSA-MIR-101 | uacaguacugauaacugaag |
| HSA-MIR-101 | uacaguacugauaacugaag | ||||
| mir-124.1 | 402 | 408 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| miR-134 | 2109 | 2115 | 1a | HSA-MIR-134脑 | ugugacuggugaccagaggg |
| mir-141/200a | 2046 | 2052 | 1a | HSA-MIR-141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
| hsa-miR-200a | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
| miR-144 | 2191 | 2197 | 1a | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
| miR-145 | 390 | 397 | 1A，M8 | HSA-MIR-145 | GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCUU |
| mir-19 | 1936年 | 1943年 | 1A，M8 | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
| HSA-MIR-19B | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
| mir-205 | 325 | 332 | 1A，M8 | hsa-miR-205 | UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG |
| mir-218 | 1711年 | 1718年 | 1A，M8 | hsa-miR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-27 | 2054 | 2060 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-30-5p | 2187 | 2193 | M8 | hsa-miR-30a-5p | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| mir-320 | 286 | 292 | 1a | hsa-miR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
| mir-339 | 503 | 509 | M8 | hsa-miR-339 | ucccuccuccaggagcuca |
| mir-485-3p | 2194 | 2200 | M8 | hsa-miR-485-3p | gucauacgggcucucucucucucu |
| mir-485-5p | 1641年 | 1647 | 1a | hsa-miR-485-5p | aggcuggccgugaugauuc |
| mir-539 | 1030 | 1037 | 1A，M8 | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |