概括
基因 9866
象征 Trim66
同义词 c11orf29 | tif1d | tif1delta
描述 包含66的三方图案
参考 MIM:612000|HGNC:HGNC:29005|ENSEMBL:ENSG00000166436|Vega:Otthumg00000150481
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.4
Pascal P值 0.785
Sherlock P值 0.318
胎儿β -1.293
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13143389 11 8680333 Trim66 5.832E-4 0.315 0.049 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
3月5日 0.87 0.89
BFAR 0.87 0.87
ZNF569 0.86 0.86
Suz12 0.86 0.87
塔达 0.86 0.85
COPB1 0.86 0.90
ELP2 0.86 0.86
METAP2 0.86 0.86
tmeff1 0.86 0.87
ZNF420 0.86 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.69 -0.78
AF347015.8 -0.67 -0.78
AF347015.31 -0.67 -0.76
AF347015.27 -0.67 -0.76
AF347015.33 -0.67 -0.76
mt-cyb -0.66 -0.76
AF347015.21 -0.64 -0.75
AF347015.15 -0.64 -0.75
AF347015.2 -0.64 -0.76
FXYD1 -0.63 -0.75

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
克拉斯的加沙表观遗传沉默 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因