基因页:Trim66
概括?
基因 | 9866 |
象征 | Trim66 |
同义词 | c11orf29 | tif1d | tif1delta |
描述 | 包含66的三方图案 |
参考 | MIM:612000|HGNC:HGNC:29005|ENSEMBL:ENSG00000166436|Vega:Otthumg00000150481 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P15.4 |
Pascal P值 | 0.785 |
Sherlock P值 | 0.318 |
胎儿β | -1.293 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13143389 | 11 | 8680333 | Trim66 | 5.832E-4 | 0.315 | 0.049 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRIM66_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
3月5日 | 0.87 | 0.89 |
BFAR | 0.87 | 0.87 |
ZNF569 | 0.86 | 0.86 |
Suz12 | 0.86 | 0.87 |
塔达 | 0.86 | 0.85 |
COPB1 | 0.86 | 0.90 |
ELP2 | 0.86 | 0.86 |
METAP2 | 0.86 | 0.86 |
tmeff1 | 0.86 | 0.87 |
ZNF420 | 0.86 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.69 | -0.78 |
AF347015.8 | -0.67 | -0.78 |
AF347015.31 | -0.67 | -0.76 |
AF347015.27 | -0.67 | -0.76 |
AF347015.33 | -0.67 | -0.76 |
mt-cyb | -0.66 | -0.76 |
AF347015.21 | -0.64 | -0.75 |
AF347015.15 | -0.64 | -0.75 |
AF347015.2 | -0.64 | -0.76 |
FXYD1 | -0.63 | -0.75 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
克拉斯的加沙表观遗传沉默 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |