基因页面:PJA2

总结吗?
GeneID 9867年
象征 PJA2
同义词 Neurodap1 | RNF131
描述 praja无名指泛素连接酶2
参考 HGNC: HGNC: 17481|运用:ENSG00000198961|HPRD: 11436|织女:OTTHUMG00000128750
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 5 q21.3
帕斯卡假定值 0.002
夏洛克假定值 0.23
胎儿β -0.74
DMG 1(#研究)
eGene 元
支持 CompositeSet
达内尔FMRP目标

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg09725147 5 108745819 PJA2 5.88 e-8 -0.012 1.49 e-5 DMG: Jaffe_2016


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
C7orf59 0.84 0.69
NDUFV3 0.83 0.66
C17orf90 0.83 0.63
SNRNP25 0.82 0.63
UCRC 0.82 0.68
AC040980.1 0.82 0.66
ZFAND2A 0.81 0.69
TMEM141 0.81 0.57
MDP1 0.81 0.66
RPS19BP1 0.80 0.65
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIF5B -0.42 -0.39
ZNF652 -0.39 -0.38
FAM107B -0.38 -0.37
MAP4K4 -0.38 -0.36
PICALM -0.35 -0.27
CLIC4 -0.35 -0.35
FMNL2 -0.35 -0.29
TBC1D12 -0.35 -0.33
LMAN1 -0.34 -0.29
CWF19L2 -0.34 -0.39

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0016874 连接酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006511 ubiquitin-dependent蛋白质分解代谢的过程 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0045211 突触后膜 国际能源机构 Synap,神经递质(术语层面:5) - - - - - -
去:0045202 突触 国际能源机构 Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) - - - - - -
去:0000139 高尔基体膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005794 高尔基体 国际能源机构 - - - - - -
去:0005789 内质网的膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -
去:0005783 内质网 国际能源机构 - - - - - -
去:0005886 等离子体膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0030054 细胞结 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
REACTOME免疫系统 933年 616年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME适应性免疫系统 539年 350年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME类我MHC抗原介导的处理报告 251年 156年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME抗原处理泛素化蛋白酶体降解 212年 129年 所有SZGR 2.0基因通路
加里CD5目标了 473年 314年 所有SZGR 2.0基因通路
DEURIG T细胞白血病PROLYMPHOCYTIC DN 320年 184年 所有SZGR 2.0基因通路
UDAYAKUMAR MED1目标了 135年 82年 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌24小时DN 214年 133年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1目标12小时 162年 116年 所有SZGR 2.0基因通路
通过小道HAMAI细胞凋亡 584年 356年 所有SZGR 2.0基因通路
阿卜杜肾癌VHL DN 14 9 所有SZGR 2.0基因通路
DN SCHLOSSER血清反应 712年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 855年 609年 所有SZGR 2.0基因通路
滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN 483年 336年 所有SZGR 2.0基因通路
胎儿肝脏DN MARTORIATI MDM4目标 514年 319年 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN NIPP1目标 848年 527年 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN EZH2目标 1024年 594年 所有SZGR 2.0基因通路
布伊泰尔特说光动力治疗压力 811年 508年 所有SZGR 2.0基因通路
沈SMARCA2目标了 424年 268年 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER活检肾移植排斥和好的DN 546年 351年 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 555年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
江缺氧正常 311年 205年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯应对TRABECTEDIN DN 271年 175年 所有SZGR 2.0基因通路
道格拉斯BMI1目标了 566年 371年 所有SZGR 2.0基因通路
BONOME卵巢癌生存非最优减积 510年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
米利伪足趋触性了 518年 299年 所有SZGR 2.0基因通路
金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 682年 440年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍CALB1 CORR 548年 370年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 124.1 1455年 1461年 1 hsa - mir - 124 a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir - 205 2152年 2158年 m8 hsa - mir - 205 UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG
mir - 323 1387年 1394年 1、m8 hsa - mir - 323大脑 GCACAUUACACGGUCGACCUCU
miR-33 2396年 2402年 1 hsa-miR-33 GUGCAUUGUAGUUGCAUUG
hsa-miR-33b GUGCAUUGCUGUUGCAUUGCA
mir - 363 65年 71年 1 hsa - mir - 363 AUUGCACGGUAUCCAUCUGUAA
mir - 380 - 5 - p 1873年 1879年 1 hsa - mir - 380 - 5 - p UGGUUGACCAUAGAACAUGCGC
hsa - mir - 563 AGGUUGACAUACGUUUCCC
mir - 410 75年 81年 1 hsa - mir - 410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
mir - 455 1249年 1256年 1、m8 hsa - mir - 455 UAUGUGCCUUUGGACUACAUCG
mir - 544 162年 169年 1、m8 hsa - mir - 544 AUUCUGCAUUUUUAGCAAGU
miR-9 1796年 1802年 1 hsa-miR-9深圳 UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA