基因页：TLK1

概括？
基因 9874
象征 TLK1
同义词 pku-beta
描述 像激酶1
参考 MIM：608438|HGNC：HGNC：11841|Ensembl：ENSG00000198586|Vega：Otthumg00000132243
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q31.1
Pascal P值 0.028
TADA P值 0.002
胎儿β -1.801
DMG 2（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
TLK1 CHR2 171902751..171902752 GT G NM_001136554
NM_001136555
NM_012290		 。
。
。		 边框
边框
边框		 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG13257190 2 172073526 TLK1 3.112E-4 0.368 0.04 DMG：Wockner_2014
CG13882835 2 172017928 TLK1 -0.019 0.94 DMG：Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16894557 CHR6 28999825 TLK1 9874 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TMEM43 0.72 0.72
ZBTB39 0.72 0.73
ZFYVE26 0.71 0.72
ikzf4 0.71 0.71
EEF2K 0.71 0.71
pol 0.71 0.69
RNF144A 0.71 0.73
ankfy1 0.70 0.73
pofut1 0.70 0.70
CRTC3 0.70 0.69
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.53 -0.59
MT-CO2 -0.53 -0.59
AF347015.21 -0.51 -0.65
AF347015.27 -0.50 -0.55
FXYD1 -0.50 -0.55
AF347015.8 -0.50 -0.57
AF347015.33 -0.50 -0.54
mt-cyb -0.49 -0.56
C5orf53 -0.49 -0.49
ifi27 -0.49 -0.53

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素DN的反应 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 275 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2向上 139 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEART HDAC增殖集群DN 76 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 DN 52 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对UV SCC DN的响应 123 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
兰普早期丰富学习环境 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C5的反应 46 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦响应集群D3 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Finetti乳腺癌Kinome Grey 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mir15a和mir16 1的Bonci目标 91 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼克对Proc处理DN的反应 27 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应 87 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin DN的反应 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rao由Sall4绑定 227 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因