Summary
GeneID 9883
象征 POM121
同义词 P145 | POM121A
描述 POM121反式membrane nucleoporin
参考 MIM:615753|HGNC:HGNC:19702|ENSEMBL:ENSG00000196313|HPRD:11448|Vega:OTTHUMG00000023527
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q11.23
Pascal P值 0.149
胎儿β -0.296
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25789201 7 72395803 POM121 8.21e-10 -0.02 1.07E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1578978 CHR8 118196802 POM121 9883 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
AGR2 Ag2 |GOB-4 |hag-2 |XAG-2 前梯度同源2(Xenopus laevis) Two-hybrid Biogrid 16189514
AP2B1 ADTB2 |AP105B |ap2-beta |clapb1 |DKFZP781K0743 与Adaptor相关的蛋白质复合物2,β1亚基 Two-hybrid Biogrid 16189514
CEP55 C10orf3 |FLJ10540 |URCC6 中心蛋白55KDA Two-hybrid Biogrid 16189514
Col4a3bp 证书|certl |FLJ20597 |GPBP |Stard11 胶原蛋白,IV型,Alpha 3(GoodPasture抗原)结合蛋白 Two-hybrid Biogrid 16189514
GFAP FLJ45472 胶质原纤维酸性蛋白 Two-hybrid Biogrid 16189514
Golga2 GM130 |MGC20672 Golgi Autoantigen,Golgin亚家族A,2 Two-hybrid Biogrid 16189514
gyg1 gyg 糖蛋白1 Two-hybrid Biogrid 16189514
LPXN LDPL Leupaxin Two-hybrid Biogrid 16189514
NFKBIA ikba |Mad-3 |nfkbi B细胞抑制剂Alpha中Kappa光多肽基因增强子的核因子 Two-hybrid Biogrid 16189514
rbpms 爱马仕 RNA结合蛋白具有多个剪接 Two-hybrid Biogrid 16189514
Tex11 TGC1 |TSGA3 睾丸表示11 Two-hybrid Biogrid 16189514
TRIM23 ard1 |arfd1 |RNF46 含三方图案23 Two-hybrid Biogrid 16189514
Trip6 MGC10556 |MGC10558 |MGC29959 |MGC3837 |MGC4423 |OIP1 |ZRP-1 甲状腺激素受体相互作用6 Two-hybrid Biogrid 16189514


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
非编码RNA的反应组代谢 49 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 66 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 140 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
成熟转录本向细胞质的反应组传输 54 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA处理 161 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
源自内在转录本的成熟mRNA的反应组传输 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome葡萄糖转运 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NEP NS2与细胞出口机械相互作用 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV感染 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
核糖核蛋白转运到宿主核的反应组转运 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期 125 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期的后期 104 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VPR与宿主细胞蛋白的反应组相互作用 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄糖激酶调节蛋白对葡萄糖激酶的反应组调节 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dirmeier LMP1响应迟到 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 38 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Pou5f1靶向DN 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时 101 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramaswamy转移 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦人RESPONSE CLUSTER D3 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McCabe Hoxc6靶向癌症 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病D7 DN 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗马胰岛素在肌肉的目标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因