基因页:POM121
Summary?
GeneID | 9883 |
象征 | POM121 |
同义词 | P145 | POM121A |
描述 | POM121反式membrane nucleoporin |
参考 | MIM:615753|HGNC:HGNC:19702|ENSEMBL:ENSG00000196313|HPRD:11448|Vega:OTTHUMG00000023527 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q11.23 |
Pascal P值 | 0.149 |
胎儿β | -0.296 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25789201 | 7 | 72395803 | POM121 | 8.21e-10 | -0.02 | 1.07E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1578978 | CHR8 | 118196802 | POM121 | 9883 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/POM121_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AGR2 | Ag2 |GOB-4 |hag-2 |XAG-2 | 前梯度同源2(Xenopus laevis) | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
AP2B1 | ADTB2 |AP105B |ap2-beta |clapb1 |DKFZP781K0743 | 与Adaptor相关的蛋白质复合物2,β1亚基 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
CEP55 | C10orf3 |FLJ10540 |URCC6 | 中心蛋白55KDA | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
Col4a3bp | 证书|certl |FLJ20597 |GPBP |Stard11 | 胶原蛋白,IV型,Alpha 3(GoodPasture抗原)结合蛋白 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
GFAP | FLJ45472 | 胶质原纤维酸性蛋白 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
Golga2 | GM130 |MGC20672 | Golgi Autoantigen,Golgin亚家族A,2 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
gyg1 | gyg | 糖蛋白1 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
LPXN | LDPL | Leupaxin | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
NFKBIA | ikba |Mad-3 |nfkbi | B细胞抑制剂Alpha中Kappa光多肽基因增强子的核因子 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
rbpms | 爱马仕 | RNA结合蛋白具有多个剪接 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
Tex11 | TGC1 |TSGA3 | 睾丸表示11 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
TRIM23 | ard1 |arfd1 |RNF46 | 含三方图案23 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
Trip6 | MGC10556 |MGC10558 |MGC29959 |MGC3837 |MGC4423 |OIP1 |ZRP-1 | 甲状腺激素受体相互作用6 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
非编码RNA的反应组代谢 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 | 66 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 | 140 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
成熟转录本向细胞质的反应组传输 | 54 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome mRNA处理 | 161 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
源自内在转录本的成熟mRNA的反应组传输 | 33 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome葡萄糖转运 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NEP NS2与细胞出口机械相互作用 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
核糖核蛋白转运到宿主核的反应组转运 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV生命周期的后期 | 104 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VPR与宿主细胞蛋白的反应组相互作用 | 33 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄糖激酶调节蛋白对葡萄糖激酶的反应组调节 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dirmeier LMP1响应迟到 | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 | 38 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Pou5f1靶向DN | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时 | 101 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 | 163 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramaswamy转移 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦人RESPONSE CLUSTER D3 | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McCabe Hoxc6靶向癌症 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病D7 DN | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗马胰岛素在肌肉的目标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |