基因页：SV2A
总结？
| GeneID | 9900 |
| 象征 | SV2A |
| 同义词 | SV2 |
| 描述 | 突触囊泡糖蛋白2a |
| 参考 | MIM：185860|HGNC：HGNC：20566|ENSEMBL：ENSG00000159164|HPRD:08922|Vega：Otthumg0000000012209 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q21.2 |
| Sherlock P值 | 0.983 |
| 胎儿β | -1.32 |
| 支持 | 胞吞作用 g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FAM83G | 0.92 | 0.36 |
| SLC5A10 | 0.90 | 0.37 |
| ZNF521 | 0.82 | 0.40 |
| IL28RA | 0.81 | 0.35 |
| epha1 | 0.80 | 0.26 |
| ATBF1 | 0.80 | 0.40 |
| HLA-DPB2 | 0.80 | 0.42 |
| madcam1 | 0.80 | 0.24 |
| FOXP2 | 0.79 | 0.18 |
| GJD2 | 0.79 | 0.25 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GTDC1 | -0.27 | -0.17 |
| SLC26A4 | -0.26 | -0.22 |
| mrgprf | -0.25 | -0.14 |
| PPP2R5A | -0.25 | -0.15 |
| mgll | -0.25 | -0.11 |
| IL34 | -0.24 | -0.16 |
| PTGD | -0.24 | -0.15 |
| tinagl1 | -0.24 | -0.12 |
| tesk2 | -0.24 | -0.18 |
| 个人电脑 | -0.24 | -0.01 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006836 | 神经递质运输 | IEA | 神经元，神经递质（GO期限：5） | - |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005783 | 内质网 | 艾达 | 11256614 | |
| 去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
| 去:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - | |
| GO：0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG ECM受体相互作用 | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee衰老的肌肉 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5目标9小时DN | 41 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP | 87 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Guillaumond KLF10靶向 | 51 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-128 | 33 | 40 | 1A，M8 | hsa - mir - 128 a | ucacagugaaccggucuuuu |
| HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
| mir-133 | 424 | 430 | 1a | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
| mir-137 | 501 | 508 | 1A，M8 | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
| mir-138 | 1037 | 1043 | 1a | HSA-MIR-138脑 | Agcugguuguguugaauc |
| mir-19 | 245 | 252 | 1A，M8 | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
| HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
| mir-218 | 1051 | 1058 | 1A，M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-22 | 620 | 626 | M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
| mir-27 | 34 | 40 | M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-421 | 617 | 623 | 1a | HSA-MIR-421 | ggccucauaauguuguug |
| mir-485-5p | 1159 | 1165 | 1a | HSA-MIR-485-5p | aggcuggccgugaugauuc |