基因页面:SLC35E2

总结吗?
GeneID 9906年
象征 SLC35E2
同义词 - - - - - -
描述 溶质载体家庭E2 35个成员
参考 HGNC: HGNC: 20863|运用:ENSG00000215790|HPRD: 15374|织女:OTTHUMG00000000823
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 1 p36.33
帕斯卡假定值 0.511
夏洛克假定值 0.567
胎儿β 0.498
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg27391816 1 1672644 SLC35E2 4.265的军医 0.621 0.045 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs332104 chr2 119446029 SLC35E2 9906年 0.17 反式
rs17029291 chr3 32402138 SLC35E2 9906年 0.15 反式
rs11520713 chr7 36419236 SLC35E2 9906年 0.17 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIF11 0.97 0.88
BRIP1 0.97 0.84
KIF15 0.97 0.87
该模型 0.97 0.82
KIF23 0.97 0.83
CEP55 0.97 0.82
SGOL1 0.97 0.76
CDCA2 0.96 0.76
地狱 0.96 0.79
MELK 0.96 0.82
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXO2 -0.44 -0.72
HLA-F -0.44 -0.80
SLC9A3R2 -0.43 -0.51
PTH1R -0.43 -0.74
C5orf53 -0.43 -0.72
TNFSF12 -0.43 -0.70
LHPP -0.43 -0.64
AIFM3 -0.42 -0.75
ALDOC -0.42 -0.72
ASPHD1 -0.42 -0.60

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
彭雷帕霉素的反应了 203年 130年 所有SZGR 2.0基因通路
华莱士前列腺癌种族DN 88年 42 所有SZGR 2.0基因通路
张核心DN血清反应 209年 137年 所有SZGR 2.0基因通路
FEVR CTNNB1目标了 682年 433年 所有SZGR 2.0基因通路