概括
基因 9911
象征 TMCC2
同义词 Hucep11
描述 跨膜和盘绕螺旋域家族2
参考 HGNC:HGNC:24239|Ensembl:ENSG00000133069|HPRD:11040|Vega:Otthumg0000000037195
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q32.1
胎儿β -0.748
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24581572 1 205197876 TMCC2 2.68e-8 -0.011 8.51E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
VDAC3 0.91 0.87
GGPS1 0.90 0.88
COPS3 0.90 0.89
MRPL3 0.89 0.89
ORC4L 0.89 0.87
dync1li1 0.89 0.87
hyls1 0.89 0.87
C16orf94 0.88 0.84
CUL2 0.88 0.84
MSL3 0.88 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.2 -0.82 -0.79
MT-CO2 -0.82 -0.75
AF347015.33 -0.82 -0.78
AF347015.8 -0.81 -0.77
AF347015.26 -0.81 -0.80
mt-cyb -0.81 -0.77
AF347015.15 -0.80 -0.77
AF347015.31 -0.79 -0.75
AF347015.27 -0.77 -0.74
higd1b -0.73 -0.74

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1的Juban目标 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因