基因页:TMCC2
概括?
基因 | 9911 |
象征 | TMCC2 |
同义词 | Hucep11 |
描述 | 跨膜和盘绕螺旋域家族2 |
参考 | HGNC:HGNC:24239|Ensembl:ENSG00000133069|HPRD:11040|Vega:Otthumg0000000037195 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q32.1 |
胎儿β | -0.748 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24581572 | 1 | 205197876 | TMCC2 | 2.68e-8 | -0.011 | 8.51E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TMCC2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
VDAC3 | 0.91 | 0.87 |
GGPS1 | 0.90 | 0.88 |
COPS3 | 0.90 | 0.89 |
MRPL3 | 0.89 | 0.89 |
ORC4L | 0.89 | 0.87 |
dync1li1 | 0.89 | 0.87 |
hyls1 | 0.89 | 0.87 |
C16orf94 | 0.88 | 0.84 |
CUL2 | 0.88 | 0.84 |
MSL3 | 0.88 | 0.84 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.2 | -0.82 | -0.79 |
MT-CO2 | -0.82 | -0.75 |
AF347015.33 | -0.82 | -0.78 |
AF347015.8 | -0.81 | -0.77 |
AF347015.26 | -0.81 | -0.80 |
mt-cyb | -0.81 | -0.77 |
AF347015.15 | -0.80 | -0.77 |
AF347015.31 | -0.79 | -0.75 |
AF347015.27 | -0.77 | -0.74 |
higd1b | -0.73 | -0.74 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPI1和FLI1的Juban目标 | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |