概括
基因 9917
象征 FAM20B
同义词 GXK1
描述 具有序列相似性的家庭20成员b
参考 MIM:611063|HGNC:HGNC:23017|Ensembl:ENSG00000116199|HPRD:13297|Vega:Otthumg00000035073
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1Q25
Sherlock P值 0.848
胎儿β -0.719
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13115240 1 178995597 FAM20B 3.73E-8 -0.008 1.08e-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ftl 0.76 0.57
sepx1 0.76 0.63
TSPAN31 0.76 0.60
C11orf59 0.75 0.69
C9orf23 0.74 0.57
Snapin 0.74 0.60
C2ORF28 0.74 0.58
TMEM149 0.74 0.54
JTB 0.74 0.56
冲浪1 0.73 0.63
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
BAT2D1 -0.36 -0.32
ank3 -0.35 -0.28
LRP1B -0.34 -0.33
BDP1 -0.34 -0.29
RBM25 -0.34 -0.31
pclo -0.33 -0.27
UPF2 -0.33 -0.29
EIF5B -0.32 -0.34
BOD1L -0.31 -0.25
mysm1 -0.31 -0.28

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 110 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈肝新陈代谢QTL顺式 93 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM监管机构 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因